Striatum

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)
• Mus musculus (House mouse)

Protein

Source

• Striatum (UBERON_0002345)  

Reported structure

• N-Linked / Complex / Man(a1-3)[Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc+"+ GlcNAc(b1-?)"
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Composition

• HexNAc:1 NeuAc:1 (avg mass : 512.4682 )
• HexNAc:2 (avg mass : 424.4053 )
• Hex:1 HexNAc:1 (avg mass : 383.3527 )
• Hex:1 HexNAc:1 Su:1 (avg mass : 463.4169 )
• Hex:1 HexNAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 690.61 )
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• Hex:1 HexNAc:1 NeuAc:1 (avg mass : 674.6106 )
• Hex:1 HexNAc:1 NeuAc:1 Su:1 (avg mass : 754.6748 )
• Hex:1 HexNAc:1 NeuAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 981.8679 )
• Hex:1 HexNAc:1 NeuAc:2 (avg mass : 965.8685 )
• Hex:1 HexNAc:1 NeuAc:2 Su:1 (avg mass : 1045.9327 )
• Hex:1 HexNAc:1 NeuAc:3 (avg mass : 1257.1264 )
• Hex:1 HexNAc:1 NeuAc:4 (avg mass : 1548.3843 )
• Hex:1 HexNAc:1 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 820.7536 )
• Hex:1 HexNAc:2 (avg mass : 586.5477 )
• Hex:1 HexNAc:2 NeuAc:1 (avg mass : 877.8056 )
• Hex:1 HexNAc:2 NeuAc:2 (avg mass : 1169.0635 )
• Hex:1 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 732.6907 )
• Hex:1 HexNAc:3 (avg mass : 789.7427 )
• Hex:2 HexNAc:1 (avg mass : 545.4951 )
• Hex:2 HexNAc:1 Su:1 (avg mass : 625.5593 )
• Hex:2 HexNAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 852.7524 )
• Hex:2 HexNAc:1 NeuAc:1 (avg mass : 836.753 )
• Hex:2 HexNAc:1 NeuAc:2 (avg mass : 1128.0109 )
• Hex:2 HexNAc:1 dHex:1 (avg mass : 691.6381 )
• Hex:2 HexNAc:1 dHex:1 Su:1 (avg mass : 771.7023 )
• Hex:2 HexNAc:1 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 982.896 )
• Hex:2 HexNAc:2 (avg mass : 748.6901 )
• Hex:2 HexNAc:2 NeuAc:1 (avg mass : 1039.948 )
• Hex:2 HexNAc:2 NeuAc:2 (avg mass : 1331.2059 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 894.8331 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1186.091 )
• Hex:2 HexNAc:3 (avg mass : 951.8851 )
• Hex:2 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1243.143 )
• Hex:2 HexNAc:3 NeuAc:2 (avg mass : 1534.4009 )
• Hex:2 HexNAc:4 (avg mass : 1155.0801 )
• Hex:3 (avg mass : 504.4425 )
• Hex:3 HexNAc:2 (avg mass : 910.8325 )
• Hex:3 HexNAc:2 NeuAc:1 (avg mass : 1202.0904 )
• Hex:3 HexNAc:2 NeuAc:2 (avg mass : 1493.3483 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1348.2334 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1203.1185 )
• Hex:3 HexNAc:3 (avg mass : 1114.0275 )
• Hex:3 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1405.2854 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
• Hex:3 HexNAc:4 (avg mass : 1317.2225 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
• Hex:3 HexNAc:5 (avg mass : 1520.4175 )
• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 1869.7555 )
• Hex:4 HexNAc:2 (avg mass : 1072.9749 )
• Hex:4 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1219.1179 )
• Hex:4 HexNAc:3 (avg mass : 1276.1699 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1568.4559 )
• Hex:4 HexNAc:4 (avg mass : 1479.3649 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2208.0237 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1771.6509 )
• Hex:4 HexNAc:5 (avg mass : 1682.5599 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 1974.8459 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2323.1558 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2178.0409 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1381.2603 )
• Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
• Hex:5 HexNAc:3 NeuAc:2 (avg mass : 2020.8281 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1875.7132 )
• Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 2661.424 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2516.3091 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2136.9883 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2428.2462 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2283.1313 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2485.2982 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2776.5561 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2340.1833 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2631.4412 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2922.6991 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:3 (avg mass : 2486.3263 )
• Hex:5 HexNAc:7 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2834.6362 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1746.5977 )
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• Hex:6 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1892.7407 )
• Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
• Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2386.1655 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2387.1936 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2242.0787 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2299.1307 )
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• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2881.6465 )
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• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:2 (avg mass : 3027.7895 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:4 (avg mass : 2591.4167 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2793.5836 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 3084.8415 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 (avg mass : 2648.4687 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2939.7266 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 NeuAc:2 (avg mass : 3230.9845 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:4 (avg mass : 2794.6117 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 3288.0365 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 3142.9216 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:4 (avg mass : 3683.3567 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 3246.9839 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:3 (avg mass : 3538.2418 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 3101.869 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:3 NeuAc:2 (avg mass : 3393.1269 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:3 NeuAc:3 (avg mass : 3684.3848 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:4 NeuAc:1 (avg mass : 3248.012 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:5 NeuAc:1 (avg mass : 3759.4924 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
• Hex:10 HexNAc:2 (avg mass : 2045.8293 )

Disease

• Control/Healthy
• Parkinson's disease (DOID:14330)

Reference

• Mammalian brain glycoproteins exhibit diminished glycan complexity compared to other tissues (2022 - Williams SE, Noel M, Lehoux S, Cetinbas M, Xavier RJ, Sadreyev RI, Scolnick EM, Smoller JW, Cummings RD, Mealer RG) / Status : Reviewed
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Reported glycosite

Mass spectrometry observed peptide