SARS coronavirus CUHK-W1

Taxonomy

• SARS coronavirus CUHK-W1

Protein

• Recombinant Spike glycoprotein (HEK293) - RBD domain / SARS coronavirus CUHK-W1    P59594

Source

• HEK293 (CVCL_0045)  

Reported structure

• N-Linked / Complex / GlcNAc(b1-?)Man(a1-3)[GlcNAc(b1-?)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(a1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Structure 10972
• N-Linked / Complex / Structure 11704
• N-Linked / Complex / Structure 11751
• N-Linked / Complex / Structure 11765
• N-Linked / Complex / Structure 11481
• N-Linked / Complex / Structure 11639
• N-Linked / Complex / Structure 11633

Composition

• Hex:3 HexNAc:3 (avg mass : 1114.0275 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
• Hex:3 HexNAc:4 (avg mass : 1317.2225 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
• Hex:3 HexNAc:5 (avg mass : 1520.4175 )
• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
• Hex:3 HexNAc:6 (avg mass : 1723.6125 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 1869.7555 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2194.0403 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )

Disease

• severe acute respiratory syndrome (DOID:2945)

Reference

• Direct Comparison of N-Glycans and Their Isomers Derived from Spike Glycoprotein 1 of MERS-CoV, SARS-CoV-1, and SARS-CoV-2 (2021 - Cho BG, Gautam S, Peng W, Huang Y, Goli M, Mechref Y) / Status : Reviewed

Reported glycosite

• Recombinant Spike glycoprotein (HEK293) - RBD domain / SARS coronavirus CUHK-W1
  •        Undefined site

Mass spectrometry observed peptide