CD109 antigen

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• CD109 antigen / Homo sapiens    Q6YHK3

Source

• Blood Serum (UBERON_0001977)  
• Mammary Gland (UBERON_0001911)  
• Umbilical Vein (UBERON_0002066)   Endothelial Cell of Umbilical Vein (CL_0002618)  

Reported structure

Composition

• Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:3 (avg mass : 1714.5989 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2516.3091 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:4 (avg mass : 2226.0793 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2387.1936 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2589.3605 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2299.1307 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2736.5316 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2792.5555 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2938.6985 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3229.9564 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 3084.8415 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:3 (avg mass : 3376.0994 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 NeuAc:2 (avg mass : 3230.9845 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 NeuAc:3 (avg mass : 3522.2424 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:8 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1867.6875 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
• Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )

Disease

• Cancer, breast (DOID:1612)
• Prostate cancer (DOID:10283)

Reference

• Large-scale intact glycopeptide identification by Mascot database search (2018 - Ravi Chand Bollineni, Christian Jeffrey Koehler, Randi Elin Gislefoss, Jan Haug Anonsen, Bernd Thiede) / Status : Unreviewed
• Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018 - Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang) / Status : Unreviewed
• Glycoproteomic analysis of the secretome of human endothelial cells (2013 - Yin X, Bern M, Xing Q, Ho J, Viner R, Mayr M.) / Status : Reviewed

Reported glycosite

• CD109 antigen / Homo sapiens
  •        Asn-41
  •        Asn-68
  •        Asn-118
  •        Asn-247
  •        Asn-279
  •        Asn-287
  •        Asn-337
  •        Asn-419
  •        Asn-513
  •        Asn-1086
  •        Asn-1295
  •        Asn-1355

Mass spectrometry observed peptide

• FLVTAPGIIRPGGNVTIGVELLEHCPSQVTVK (32aa)
  •    Q6YHK3    Asn-41
• TASNLTVSVLEAEGVFEK (18aa)
  •    Q6YHK3    Asn-68
• TQDEIIFSNSTR (12aa)
  •    Q6YHK3    Asn-118
• TQDEILFSNSTR (12aa)
  •    Q6YHK3    Asn-118
• HLNGTITAK (9aa)
  •    Q6YHK3    Asn-247
• HINGTITAK (9aa)
  •    Q6YHK3    Asn-247
• INGSANFSFNDEEMK (15aa)
  •    Q6YHK3    Asn-287
• NVSTNVFFK (9aa)
  •    Q6YHK3    Asn-337
• INYTVPQSGTFK (12aa)
  •    Q6YHK3    Asn-419
• QNSTMFSLTPENSWTPK (17aa)
  •    Q6YHK3    Asn-513
• GISDNYTLALITYALSSVGSPK (22aa)
  •    Q6YHK3    Asn-1086
• DDLNHVDLNVCTSFSGPGR (19aa)
  •    Q6YHK3    Asn-1295
• LNLYLDSVNETQFCVNIPAVR (21aa)
  •    Q6YHK3    Asn-1355