CD59 glycoprotein

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• CD59 glycoprotein / Homo sapiens    P13987

Source

• Mammary Gland (UBERON_0001911)  
• Milk (UBERON_0001913)  
• Ovary (UBERON_0000992)   CHO (CVCL_0213)  
• Umbilical Vein (UBERON_0002066)   Endothelial Cell of Umbilical Vein (CL_0002618)  
• Urine (UBERON_0001088)  

Reported structure

• N-Linked / Complex / GlcNAc(b1-2)Man(a1-3)[GlcNAc(b1-2)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)[GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(a1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-3)[Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-3)[Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(a1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / NeuAc(a2-?)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)[Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc
• N-Linked / Complex / NeuAc(a2-?)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)[Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(a1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)[Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(a1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Structure 9425
• N-Linked / Complex / Structure 9372
• N-Linked / Complex / Structure 9498
• N-Linked / Complex / Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)[Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(a1-6)]GlcNAc+"+ Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)"
• N-Linked / Complex / Structure 9490
• N-Linked / Complex / Structure 9451
• N-Linked / Complex / Structure 9414
• N-Linked / Complex / Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)[Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(a1-6)]GlcNAc+"+ 2 x Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)"
• N-Linked / Complex / Structure 9472
• N-Linked / Complex / Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)[Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(a1-6)]GlcNAc+"+ 3 x Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)"

Composition

• HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 773.7433 )
• Hex:1 HexNAc:1 NeuAc:3 (avg mass : 1257.1264 )
• Hex:1 HexNAc:2 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1023.9486 )
• Hex:1 HexNAc:3 (avg mass : 789.7427 )
• Hex:1 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 935.8857 )
• Hex:1 HexNAc:4 (avg mass : 992.9377 )
• Hex:1 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1139.0807 )
• Hex:2 HexNAc:2 (avg mass : 748.6901 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 894.8331 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1186.091 )
• Hex:2 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1098.0281 )
• Hex:2 HexNAc:4 (avg mass : 1155.0801 )
• Hex:2 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1447.3661 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
• Hex:3 HexNAc:4 (avg mass : 1317.2225 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1609.5085 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 2468.2707 )
• Hex:3 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 2479.3405 )
• Hex:4 HexNAc:4 NeuGc:1 (avg mass : 1786.6222 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1916.7658 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 1917.7939 )
• Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 1973.8178 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 2427.2181 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2411.2187 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2266.1038 )
• Hex:4 HexNAc:7 dHex:2 (avg mass : 2381.2359 )
• Hex:4 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 2641.4829 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:3 (avg mass : 1876.7413 )
• Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuGc:2 (avg mass : 2402.1649 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 2386.1655 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 NeuGc:2 (avg mass : 2694.4509 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2371.1942 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 NeuAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 2678.4515 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 NeuAc:2 (avg mass : 2662.4521 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:4 (avg mass : 2226.0793 )
• Hex:5 HexNAc:5 (avg mass : 1844.7023 )
• Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2135.9602 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2573.3611 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2136.9883 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2428.2462 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2283.1313 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuGc:3 (avg mass : 3115.8122 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2485.2982 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:3 (avg mass : 2486.3263 )
• Hex:5 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 2600.4303 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:3 (avg mass : 2038.8837 )
• Hex:6 HexNAc:4 (avg mass : 1803.6497 )
• Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2242.0787 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 NeuGc:1 (avg mass : 2896.6178 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:3 (avg mass : 2880.6184 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuGc:1 (avg mass : 2460.245 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuGc:2 (avg mass : 2767.5023 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 2751.5029 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:2 (avg mass : 3058.7602 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 NeuGc:1 (avg mass : 3042.7608 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2590.3886 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuGc:1 (avg mass : 2752.531 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2736.5316 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2501.2976 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 2808.5549 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2647.4406 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 2954.6979 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2938.6985 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2502.3257 )
• Hex:6 HexNAc:7 (avg mass : 2413.2347 )
• Hex:6 HexNAc:8 (avg mass : 2616.4297 )
• Hex:7 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2257.05 )
• Hex:7 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 2111.9351 )
• Hex:7 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2258.0781 )
• Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2315.1301 )
• Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2606.388 )
• Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 2913.6453 )
• Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2897.6459 )
• Hex:7 HexNAc:6 (avg mass : 2372.1821 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuGc:1 (avg mass : 2679.4394 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:3 (avg mass : 3245.9558 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:3 NeuGc:1 (avg mass : 3553.2131 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3100.8409 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3392.0988 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:4 NeuAc:1 (avg mass : 3248.012 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2721.5201 )
• Hex:7 HexNAc:8 (avg mass : 2778.5721 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:8 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2971.7254 )
• Hex:8 HexNAc:7 NeuAc:1 (avg mass : 3028.7774 )
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2883.6625 )
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 3174.9204 )
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3466.1783 )
• Hex:9 HexNAc:6 (avg mass : 2696.4669 )
• Hex:9 HexNAc:8 NeuAc:1 (avg mass : 3394.1148 )
• Hex:9 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 3248.9999 )
• Hex:10 HexNAc:2 (avg mass : 2045.8293 )
• Hex:10 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 3296.0102 )
• Hex:10 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 3614.3373 )
• Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )

Disease

• Cancer, breast (DOID:1612)
• Prostate cancer (DOID:10283)

Reference

• Quantitative Longitudinal Inventory of the N-Glycoproteome of Human Milk from a Single Donor Reveals the Highly Variable Repertoire and Dynamic Site-Specific Changes (2020 - Jing Zhu, Yu-Hsien Lin, Kelly A Dingess, Marko Mank, Bernd Stahl, Albert J R Heck) / Status : Reviewed
• Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018 - Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang) / Status : Unreviewed
• Distinct urinary glycoprotein signatures in prostate cancer patients (2018 - Rebeca Kawahara, Fabio Ortega, Livia Rosa-Fernandes, Vanessa Guimarães, Daniel Quina, Willian Nahas, Veit Schwämmle, Miguel Srougi, Katia R.M. Leite, Morten Thaysen-Andersen, Martin R. Larsen and Giuseppe Palmisano) / Status : Unreviewed
• Glycoproteomic analysis of the secretome of human endothelial cells (2013 - Yin X, Bern M, Xing Q, Ho J, Viner R, Mayr M.) / Status : Reviewed
• Oligosaccharide analysis and molecular modeling of soluble forms of glycoproteins belonging to the Ly-6, scavenger receptor, and immunoglobulin superfamilies expressed in Chinese hamster ovary cells. (1999 - Rudd P, Wormald M, Harvey D, Devasahayam M, McAlister M, Brown M, Davis S, Barclay A, Dwek R) / Status : Reviewed
• Structural study on the glycosyl-phosphatidylinositol anchor and the asparagine-linked sugar chain of a soluble form of CD59 in human urine. (1994 - Nakano Y, Noda K, Endo T, Kobata A, Tomita M) / Status : Reviewed

Reported glycosite

• CD59 glycoprotein / Homo sapiens
  •        Undefined site
  •        Thr-40
  •        Asn-43
  •        Thr-105
  •        Ser-106
  •        Thr-111

Mass spectrometry observed peptide

• TAVNCSSDFDACLITKAGLQVYNKCWK (27aa)
  •    P13987    Thr-40     CD59 glycoprotein / Homo sapiens
• TAVNCSSDFDACLITKAGLQVYNK (24aa)
  •    P13987    Thr-40     CD59 glycoprotein / Homo sapiens
• TAVNCSSDFDACIITK (16aa)
  •    P13987    Asn-43     CD59 glycoprotein / Homo sapiens
• KTAVNCSSDFDACLITKA (18aa)
  •    P13987    Asn-43     CD59 glycoprotein / Homo sapiens
• TAVNCSSDFDACLITK (16aa)
  •    P13987    Asn-43     CD59 glycoprotein / Homo sapiens
  •    P13987    Thr-40     CD59 glycoprotein / Homo sapiens
• KDLCNFNEQLENGGTSLSEK (20aa)
  •    P13987    Thr-105     CD59 glycoprotein / Homo sapiens
• DLCNFNEQLENGGTSLSEK (19aa)
  •    P13987    Ser-106     CD59 glycoprotein / Homo sapiens
  •    P13987    Thr-105     CD59 glycoprotein / Homo sapiens
• DLCNFNEQLENGGTSLSEKTVLLLVTPFLAAAWSLHP (37aa)
  •    P13987    Ser-106     CD59 glycoprotein / Homo sapiens
  •    P13987    Thr-111     CD59 glycoprotein / Homo sapiens