Clusterin

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• Clusterin / Homo sapiens    P10909

Source

• Blood Plasma (UBERON_0001969)  
• Blood Serum (UBERON_0001977)  
• Mammary Gland (UBERON_0001911)  
• Urine (UBERON_0001088)  
• Cerebrospinal Fluid Secretion (GO_0033326)  

Reported structure

• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc
• N-Linked / Complex / Structure 3041
• N-Linked / Complex / Structure 3534
• N-Linked / Complex / NeuAc(?2-?)Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-3)[NeuAc(?2-?)Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc

Composition

• Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
• Hex:3 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1608.4804 )
• Hex:3 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 1899.7383 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1754.6234 )
• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 1869.7555 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2161.0134 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2015.8985 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2307.1564 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:3 (avg mass : 2162.0415 )
• Hex:3 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2072.9505 )
• Hex:3 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 2276.1455 )
• Hex:4 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1219.1179 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1713.5708 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1568.4559 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:3
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1916.7658 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1771.6509 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 1917.7939 )
• Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 1973.8178 )
• Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2265.0757 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2411.2187 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 1974.8459 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2266.1038 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2120.9889 )
• Hex:4 HexNAc:6 (avg mass : 1885.7549 )
• Hex:4 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2177.0128 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2178.0409 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1729.5702 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1730.5983 )
• Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2371.1942 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:4
• Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2135.9602 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2573.3611 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2136.9883 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2428.2462 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2283.1313 )
• Hex:5 HexNAc:6 (avg mass : 2047.8973 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2485.2982 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3067.814 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2340.1833 )
• Hex:5 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 2600.4303 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:3 (avg mass : 1600.4547 )
• Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
• Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2386.1655 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2589.3605 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:3 (avg mass : 2880.6184 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2299.1307 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2590.3886 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2881.6465 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:3
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:1
• Hex:6 HexNAc:6 (avg mass : 2210.0397 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2501.2976 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2792.5555 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:3 (avg mass : 3083.8134 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2647.4406 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2938.6985 )
• Hex:6 HexNAc:7 (avg mass : 2413.2347 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2897.6459 )
• Hex:7 HexNAc:6 (avg mass : 2372.1821 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2663.44 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3100.8409 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3392.0988 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:4 (avg mass : 3683.3567 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:8 HexNAc:7 (avg mass : 2737.5195 )
• Hex:8 HexNAc:7 NeuAc:1
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2883.6625 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
• Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )

Disease

• Cancer, breast (DOID:1612)
• Esophageal cancer (DOID:5041)
• Prostate cancer (DOID:10283)

Reference

• Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018 - Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang) / Status : Unreviewed
• Site-Specific Profiling of Serum Glycoproteins Using N-Linked Glycan and Glycosite Analysis Revealing Atypical N-Glycosylation Sites on Albumin and α-1B-Glycoprotein (2018 - Shisheng Sun, Yingwei Hu, Li Jia, Shadi Toghi Eshghi, Yang Liu, Punit Shah, Hui Zhang) / Status : Unreviewed
• Large-scale intact glycopeptide identification by Mascot database search (2018 - Ravi Chand Bollineni, Christian Jeffrey Koehler, Randi Elin Gislefoss, Jan Haug Anonsen, Bernd Thiede) / Status : Unreviewed
• Distinct urinary glycoprotein signatures in prostate cancer patients (2018 - Rebeca Kawahara, Fabio Ortega, Livia Rosa-Fernandes, Vanessa Guimarães, Daniel Quina, Willian Nahas, Veit Schwämmle, Miguel Srougi, Katia R.M. Leite, Morten Thaysen-Andersen, Martin R. Larsen and Giuseppe Palmisano) / Status : Unreviewed
• Computational framework for identification of intact glycopeptides in complex samples (2014 - Mayampurath A, Yu CY, Song E, Balan J, Mechref Y, Tang H.) / Status : Reviewed
• Selective glycopeptide profiling by acetone enrichment and LC/MS (2014 - Takakura D, Harazono A, Hashii N, Kawasaki N) / Status : Reviewed
• Enrichment of glycopeptides for glycan structure and attachment site identification (2009 - Nilsson J, Rüetschi U, Halim A, Hesse C, Carlsohn E, Brinkmalm G, Larson G.) / Status : Reviewed

Reported glycosite

• Clusterin / Homo sapiens
  •        Asn-86
  •        Asn-103
  •        Asn-145
  •        Asn-291
  •        Asn-354
  •        Asn-374

Mass spectrometry observed peptide

• EDALNETR (8aa)
  •    P10909    Asn-86
• KEDALNETR (9aa)
  •    P10909    Asn-86
• TKLKELPGVCNE (12aa)
  •    P10909    Asn-103
• LPGVCNETMMALWEECKPCLK (21aa)
  •    P10909    Asn-103
• IKEIPGVCNETMMAIWEECKPCIK (24aa)
  •    P10909    Asn-103
• ELPGVCNETMMALWEECKPC (20aa)
  •    P10909    Asn-103
• ELPGVCNETMMALWEECK (18aa)
  •    P10909    Asn-103
• ELPGVCNETMMALWEECKPCLK (22aa)
  •    P10909    Asn-103
• QLEEFLNQ (8aa)
  •    P10909    Asn-145
• QIEEFINQSSPFY (13aa)
  •    P10909    Asn-145
• QLEEFLNQSSPFYFWMNGDR (20aa)
  •    P10909    Asn-145
• QIEEFINQSSPFYFWMNGDR (20aa)
  •    P10909    Asn-145
• QLEEFLNQSSPF (12aa)
  •    P10909    Asn-145
• HNSTGCLR (8aa)
  •    P10909    Asn-291
• LNTSSLLEQLNEQFNWVSR (19aa)
  •    P10909    Asn-354
• MLNTSSLLEQLNEQFNWVSR (20aa)
  •    P10909    Asn-354
• MINTSSIIEQINEQFNWVSR (20aa)
  •    P10909    Asn-354
• IANITQGEDQYYIR (14aa)
  •    P10909    Asn-374
• LANLTQGEDQYYLR (14aa)
  •    P10909    Asn-374