Thrombospondin-1

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• Thrombospondin-1 / Homo sapiens    P07996

Source

• Blood Serum (UBERON_0001977)  
• Mammary Gland (UBERON_0001911)  
• Umbilical Vein (UBERON_0002066)   Endothelial Cell of Umbilical Vein (CL_0002618)  
• Platelet (CL_0000233)  

Reported structure

• C-Linked / Undefined core / Man
• O-Linked / No-core / Glc(?1-?)Fuc

Composition

• Hex:1 (avg mass : 180.1577 )
• Hex:1 dHex:1 (avg mass : 326.3007 )
• Hex:3 HexNAc:2 (avg mass : 910.8325 )
• Hex:3 HexNAc:4 (avg mass : 1317.2225 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
• Hex:3 HexNAc:5 (avg mass : 1520.4175 )
• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
• Hex:3 HexNAc:6 (avg mass : 1723.6125 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 1869.7555 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2161.0134 )
• Hex:3 HexNAc:7 (avg mass : 1926.8075 )
• Hex:3 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2072.9505 )
• Hex:4 HexNAc:3 (avg mass : 1276.1699 )
• Hex:4 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1567.4278 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1713.5708 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1568.4559 )
• Hex:4 HexNAc:4 (avg mass : 1479.3649 )
• Hex:4 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1770.6228 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1916.7658 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1771.6509 )
• Hex:4 HexNAc:5 (avg mass : 1682.5599 )
• Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 1973.8178 )
• Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2265.0757 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2411.2187 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 1974.8459 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2266.1038 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2120.9889 )
• Hex:4 HexNAc:6 (avg mass : 1885.7549 )
• Hex:4 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2177.0128 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
• Hex:4 HexNAc:7 (avg mass : 2088.9499 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
• Hex:5 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1729.5702 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1730.5983 )
• Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2516.3091 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:4 (avg mass : 2226.0793 )
• Hex:5 HexNAc:5 (avg mass : 1844.7023 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2283.1313 )
• Hex:5 HexNAc:6 (avg mass : 2047.8973 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2194.0403 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2340.1833 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:3 (avg mass : 1600.4547 )
• Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1746.5977 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1892.7407 )
• Hex:6 HexNAc:4 (avg mass : 1803.6497 )
• Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2242.0787 )
• Hex:6 HexNAc:5 (avg mass : 2006.8447 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2589.3605 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
• Hex:6 HexNAc:6 (avg mass : 2210.0397 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2792.5555 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2356.1827 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 2111.9351 )
• Hex:7 HexNAc:6 (avg mass : 2372.1821 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
• Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )

Disease

• Cancer, breast (DOID:1612)
• Prostate cancer (DOID:10283)

Reference

• Large-scale intact glycopeptide identification by Mascot database search (2018 - Ravi Chand Bollineni, Christian Jeffrey Koehler, Randi Elin Gislefoss, Jan Haug Anonsen, Bernd Thiede) / Status : Unreviewed
• Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018 - Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang) / Status : Unreviewed
• Site-Specific Profiling of Serum Glycoproteins Using N-Linked Glycan and Glycosite Analysis Revealing Atypical N-Glycosylation Sites on Albumin and α-1B-Glycoprotein (2018 - Shisheng Sun, Yingwei Hu, Li Jia, Shadi Toghi Eshghi, Yang Liu, Punit Shah, Hui Zhang) / Status : Unreviewed
• Glycoproteomic analysis of the secretome of human endothelial cells (2013 - Yin X, Bern M, Xing Q, Ho J, Viner R, Mayr M.) / Status : Reviewed
• C-mannosylation and O-fucosylation of the thrombospondin type 1 module. (2001 - Hofsteenge J, Huwiler K, Macek B, Hess D, Lawler J, Mosher D, Peter-Katalinic J) / Status : Reviewed

Reported glycosite

• Thrombospondin-1 / Homo sapiens
  •        Asn-248
  •        Asn-360
  •        Trp-385
  •        Ser-394
  •        Trp-438
  •        Trp-441
  •        Thr-450
  •        Trp-498
  •        Thr-507
  •        Asn-520
  •        Asn-708
  •        Asn-1051
  •        Asn-1067

Mass spectrometry observed peptide

• LTLDNNVVNGSSPAIR (16aa)
  •    P07996    Asn-248
• TLDNNVVNGSSPAIR (15aa)
  •    P07996    Asn-248
• GCSSSTSVLLTLDNNVVNGSSPAIR (25aa)
  •    P07996    Asn-248
• NVVNGSSPAIR (11aa)
  •    P07996    Asn-248
• SNATVPDGECCPR (13aa)
  •    P07996    Asn-360
• VSCPIMPCSNATVPDGECCPR (21aa)
  •    P07996    Asn-360
• KVSCPIMPCSNATVPDGECCPR (22aa)
  •    P07996    Asn-360
• LCNNPTPQFGGK (12aa)
  •    P07996    Asn-520
• PGYAGNGIICGEDTDLDGWPNENLVCVANATYHCK (35aa)
  •    P07996    Asn-708
• CECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPNENLVCVANATYHCK (39aa)
  •    P07996    Asn-708
• QVTQSYWDTNPTR (13aa)
  •    P07996    Asn-1051
• VVNSTTGPGEHIR (13aa)
  •    P07996    Asn-1067
• VVNSTTGPGEHLR (13aa)
  •    P07996    Asn-1067
• VVNSTTGPGEHL (12aa)
  •    P07996    Asn-1067