Neuroligin 1

Taxonomy

• Rattus norvegicus (Norway rat)

Protein

• Neuroligin 1 / Rattus norvegicus    Q62765

Source

• Kidney (UBERON_0002113)   HEK293-EBNA (CVCL_6974)  

Reported structure

• O-Linked / Undefined core / Hex(?1-?)HexNAc
• O-Linked / Undefined core / Hex(?1-?)HexNAc+"+ NeuAc"
• O-Linked / Core 1 / NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)[NeuAc(?2-?)]HexNAc
• N-Linked / Complex / HexNAc(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-3)[HexNAc(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / HexNAc(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-3)[HexNAc(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ HSO3"
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-3)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ HexNAc"
• N-Linked / Complex / HexNAc(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-3)[HexNAc(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ Fuc(?1-?)"
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)[HexNAc(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ NeuAc"
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)[HexNAc(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ NeuAc + HSO3"
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ Fuc"
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)[HexNAc(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ NeuAc + Fuc"
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ HexNAc"
• N-Linked / Complex / NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-3)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)[NeuAc(?2-?)HexNAc(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ NeuAc"
• N-Linked / Undefined core / HexNAc(?1-?)Man(a1-?)[HexNAc(?1-?)[HexNAc (?1-?)]Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ (2 x Hex) + HexNAc + NeuAc"
• N-Linked / Complex / NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-3)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ HexNAc"
• N-Linked / Undefined core / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ HexNAc + NeuAc"
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ 2 x NeuAc"
• N-Linked / Complex / HexNAc(?1-?)Man(a1-?)[HexNAc(?1-?)[HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ (2 x Hex) + HexNAc + (2 x NeuAc)"
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ NeuAc"
• N-Linked / Undefined core / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ HexNAc + (2 x NeuAc)"
• N-Linked / Complex / NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ 2 x NeuAc"
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[HexNAc(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ 2 x NeuAc"
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ HexNAc + (2 x NeuAc)"
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)[Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[HexNAc(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ (3 x NeuAc)"
• N-Linked / Undefined core / Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc+"+ HexNAc"
• N-Linked / Complex / NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-3)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)[NeuAc(?2-?)Hex(?1-?)HexNAc(?1-?)]Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-?)]GlcNAc

Composition

• Hex:1 HexNAc:1 (avg mass : 383.3527 )
• Hex:1 HexNAc:1 NeuAc:1 (avg mass : 674.6106 )
• Hex:1 HexNAc:1 NeuAc:2 (avg mass : 965.8685 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 1869.7555 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 Su:1 (avg mass : 1949.8197 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2015.8985 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 Su:1 (avg mass : 2200.025 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2411.2187 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2266.1038 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2573.3611 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2485.2982 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2776.5561 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2647.4406 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2938.6985 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3141.8935 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3433.1514 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3100.8409 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3392.0988 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:4 (avg mass : 3683.3567 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3304.0359 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3595.2938 )

Disease

Reference

• Structural characterization of recombinant soluble rat neuroligin 1: mapping of secondary structure and glycosylation by mass spectrometry. (2004 - Hoffman RC, Jennings LL, Tsigelny I, Comoletti D, Flynn RE, Sudhof TC, Taylor P) / Status : Reviewed

Reported glycosite

• Neuroligin 1 / Rattus norvegicus
  •        Undefined site

Mass spectrometry observed peptide