Lysosome-associated membrane glycoprotein 2

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• Lysosome-associated membrane glycoprotein 2 / Homo sapiens    P13473

Source

• Blood Serum (UBERON_0001977)  
• Mammary Gland (UBERON_0001911)  
• Umbilical Vein (UBERON_0002066)   Endothelial Cell of Umbilical Vein (CL_0002618)  
• Plasma Membrane (GO_0005886)  

Reported structure

• O-Linked / Core 0 / GalNAc
• O-Linked / Core 1 / Gal(b1-3)GalNAc
• O-Linked / Core 2 / Gal(b1-4)GlcNAc(b1-6)[Gal(b1-3)]GalNAc

Composition

• HexNAc:1 (avg mass : 221.2103 )
• Hex:1 HexNAc:1 (avg mass : 383.3527 )
• Hex:2 HexNAc:2 (avg mass : 748.6901 )
• Hex:3 HexNAc:2 (avg mass : 910.8325 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1406.3135 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1754.6234 )
• Hex:3 HexNAc:6 (avg mass : 1723.6125 )
• Hex:3 HexNAc:8 (avg mass : 2130.0025 )
• Hex:3 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 2276.1455 )
• Hex:4 HexNAc:2 (avg mass : 1072.9749 )
• Hex:4 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1219.1179 )
• Hex:4 HexNAc:3 (avg mass : 1276.1699 )
• Hex:4 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1567.4278 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1713.5708 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1568.4559 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:3 (avg mass : 1714.5989 )
• Hex:4 HexNAc:4 (avg mass : 1479.3649 )
• Hex:4 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1770.6228 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1916.7658 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1771.6509 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 1917.7939 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2120.9889 )
• Hex:4 HexNAc:6 (avg mass : 1885.7549 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1381.2603 )
• Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
• Hex:5 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1729.5702 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1730.5983 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:3 (avg mass : 1876.7413 )
• Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2516.3091 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:4 (avg mass : 2226.0793 )
• Hex:5 HexNAc:5 (avg mass : 1844.7023 )
• Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2135.9602 )
• Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2427.2181 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2573.3611 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2136.9883 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2428.2462 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2283.1313 )
• Hex:5 HexNAc:6 (avg mass : 2047.8973 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2194.0403 )
• Hex:5 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 2600.4303 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:3 (avg mass : 1600.4547 )
• Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1746.5977 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2037.8556 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1892.7407 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:3 (avg mass : 2038.8837 )
• Hex:6 HexNAc:4 (avg mass : 1803.6497 )
• Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2242.0787 )
• Hex:6 HexNAc:5 (avg mass : 2006.8447 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2589.3605 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:3 (avg mass : 2880.6184 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2299.1307 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2590.3886 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2736.5316 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:4 (avg mass : 2591.4167 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:7 (avg mass : 3029.8457 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2501.2976 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2792.5555 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:3 (avg mass : 3083.8134 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2356.1827 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2647.4406 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2938.6985 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3229.9564 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:3 (avg mass : 3376.0994 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2559.3777 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 2111.9351 )
• Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2897.6459 )
• Hex:7 HexNAc:6 (avg mass : 2372.1821 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2663.44 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:4 (avg mass : 3537.2137 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3100.8409 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3392.0988 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:4 (avg mass : 3683.3567 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2664.4681 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:4 (avg mass : 2956.7541 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:4 NeuAc:1 (avg mass : 3248.012 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:5 NeuAc:4 (avg mass : 4267.9287 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2721.5201 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:8 HexNAc:7 (avg mass : 2737.5195 )
• Hex:8 HexNAc:7 NeuAc:1 (avg mass : 3028.7774 )
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2883.6625 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
• Hex:9 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3425.1257 )
• Hex:9 HexNAc:8 NeuAc:1 (avg mass : 3394.1148 )
• Hex:9 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 3248.9999 )
• Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )

Disease

• Cancer, breast (DOID:1612)
• Leukemia, Myloid, Chronic (DOID:8552)
• Prostate cancer (DOID:10283)

Reference

• Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018 - Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang) / Status : Unreviewed
• Large-scale intact glycopeptide identification by Mascot database search (2018 - Ravi Chand Bollineni, Christian Jeffrey Koehler, Randi Elin Gislefoss, Jan Haug Anonsen, Bernd Thiede) / Status : Unreviewed
• Site-Specific Profiling of Serum Glycoproteins Using N-Linked Glycan and Glycosite Analysis Revealing Atypical N-Glycosylation Sites on Albumin and α-1B-Glycoprotein (2018 - Shisheng Sun, Yingwei Hu, Li Jia, Shadi Toghi Eshghi, Yang Liu, Punit Shah, Hui Zhang) / Status : Unreviewed
• Glycoproteomic analysis of the secretome of human endothelial cells (2013 - Yin X, Bern M, Xing Q, Ho J, Viner R, Mayr M.) / Status : Reviewed
• Assignment of O-glycan attachment sites to the hinge-like regions of human lysosomal membrane glycoproteins lamp-1 and lamp-2. (1993 - Carlsson S, Lycksell P, Fukuda M) / Status : Reviewed

Reported glycosite

• Lysosome-associated membrane glycoprotein 2 / Homo sapiens
  •        Undefined site
  •        Asn-32
  •        Asn-49
  •        Asn-58
  •        Asn-75
  •        Asn-101
  •        Asn-123
  •        Asn-229
  •        Asn-242
  •        Asn-253
  •        Asn-257
  •        Asn-275
  •        Asn-300
  •        Asn-356

Mass spectrometry observed peptide

• LELNLTDSENATCLYAK (17aa)
  •    P13473    Asn-32
• WQMNFTVR (8aa)
  •    P13473    Asn-49
• YETTNK (6aa)
  •    P13473    Asn-58
• TVTISDHGTVTYNGSICGDDQNGPK (25aa)
  •    P13473    Asn-75
• IAVQFGPGFSWIANFTK (17aa)
  •    P13473    Asn-101
• AASTYSIDSVSFSYNTGDNTTFPDAEDK (28aa)
  •    P13473    Asn-123
• SIDSVSFSYNTGDNTTFPDAEDK (23aa)
  •    P13473    Asn-123
• TMGLQLNITQDK (12aa)
  •    P13473    Asn-242
• QLNITQDK (8aa)
  •    P13473    Asn-242
• GLQLNITQDK (10aa)
  •    P13473    Asn-242
• MGLQLNITQDK (11aa)
  •    P13473    Asn-242
• VASVININPNTTHSTGSCR (19aa)
  •    P13473    Asn-253
• VASVININPNTTHSTGSCR (19aa)
  •    P13473    Asn-257
• LNSSTIK (7aa)
  •    P13473    Asn-275
• EVNISMY (7aa)
  •    P13473    Asn-300
• VQPFNVTQGK (10aa)
  •    P13473    Asn-356