Isoform 2D of Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1

Taxonomy

• Mus musculus (House mouse)

Protein

• Isoform 2D of Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1 / Mus musculus    O08532-4

Source

• Brain (UBERON_0000955)  

Reported structure

Composition

• HexNAc:1 (avg mass : 221.2103 )
• HexNAc:2 (avg mass : 424.4053 )
• Hex:1 HexNAc:2 (avg mass : 586.5477 )
• Hex:2 HexNAc:2 (avg mass : 748.6901 )
• Hex:3 HexNAc:2 (avg mass : 910.8325 )
• Hex:3 HexNAc:3 (avg mass : 1114.0275 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
• Hex:3 HexNAc:6 (avg mass : 1723.6125 )
• Hex:4 HexNAc:2 (avg mass : 1072.9749 )
• Hex:4 HexNAc:3 (avg mass : 1276.1699 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
• Hex:4 HexNAc:6 (avg mass : 1885.7549 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
• Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )

Disease

Reference

• Capturing site-specific heterogeneity with large-scale N-glycoproteome analysis (2019 - Nicholas M. Riley, Alexander S. Hebert, Michael S. Westphall & Joshua J. Coon ) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Isoform 2D of Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1 / Mus musculus
  •        Asn-92
  •        Asn-136
  •        Asn-324
  •        Asn-580
  •        Asn-658
  •        Asn-764
  •        Asn-807
  •        Asn-871
  •        Asn-968
  •        Asn-981

Mass spectrometry observed peptide

• LLSNR (5aa)
  •    O08532-4    Asn-92
• DDLDPERNESEPGSQR (16aa)
  •    O08532-4    Asn-136
• VQAAHQWREDFASNEVVYYNAKDDLDPERNESEPGSQR (38aa)
  •    O08532-4    Asn-136
• EDFASNEVVYYNAKDDLDPERNESEPGSQR (30aa)
  •    O08532-4    Asn-136
• DAVNNITAK (9aa)
  •    O08532-4    Asn-324
• VLKDAVNNITAK (12aa)
  •    O08532-4    Asn-324
• KVLKDAVNNITAK (13aa)
  •    O08532-4    Asn-324
• YIDKGNR (7aa)
  •    O08532-4    Asn-580
• EYCNDLKPSDNNTEFLLNFNEFIDRK (26aa)
  •    O08532-4    Asn-658
• SLDNDNYVFTAPYFNK (16aa)
  •    O08532-4    Asn-764
• IDVNSWIENFTK (12aa)
  •    O08532-4    Asn-807
• HLVNISLYAFNK (12aa)
  •    O08532-4    Asn-871
• QSCITEQTQYFFKNDTK (17aa)
  •    O08532-4    Asn-968
• SFSGLLDCGNCSR (13aa)
  •    O08532-4    Asn-981