Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma / Homo sapiens    P23470

Source

• Blood Serum (UBERON_0001977)  

Reported structure

Composition

• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2516.3091 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2589.3605 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2881.6465 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:3 (avg mass : 3172.9044 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2792.5555 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2938.6985 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 NeuAc:2 (avg mass : 3230.9845 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )

Disease

• Prostate cancer (DOID:10283)

Reference

• Large-scale intact glycopeptide identification by Mascot database search (2018 - Ravi Chand Bollineni, Christian Jeffrey Koehler, Randi Elin Gislefoss, Jan Haug Anonsen, Bernd Thiede) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma / Homo sapiens
  •        Asn-444
  •        Asn-619
  •        Asn-722
  •        Asn-813
  •        Asn-1181
  •        Asn-1207

Mass spectrometry observed peptide

• SDFSQTMLFQANTTR (15aa)
  •    P23470    Asn-444
• NQTEPSPTPSSPNR (14aa)
  •    P23470    Asn-619
• NTSGMISRPAPGR (13aa)
  •    P23470    Asn-722
• VVPNESIPIIPIPDDMEAIPVK (22aa)
  •    P23470    Asn-813
• NSSVVPSER (9aa)
  •    P23470    Asn-1181
• GTDYINASYIMGYYR (15aa)
  •    P23470    Asn-1207