Protocadherin-9

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• Protocadherin-9 / Homo sapiens    Q9HC56

Source

• Blood Serum (UBERON_0001977)  

Reported structure

Composition

• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:3 (avg mass : 2880.6184 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:3 (avg mass : 3083.8134 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:2
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 NeuAc:2

Disease

• Prostate cancer (DOID:10283)

Reference

• Large-scale intact glycopeptide identification by Mascot database search (2018 - Ravi Chand Bollineni, Christian Jeffrey Koehler, Randi Elin Gislefoss, Jan Haug Anonsen, Bernd Thiede) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Protocadherin-9 / Homo sapiens
  •        Asn-306
  •        Asn-368
  •        Asn-664
  •        Asn-754

Mass spectrometry observed peptide

• LFALNNTTGLITVQR (15aa)
  •    Q9HC56    Asn-306
• YIISPINGTVYLSEK (15aa)
  •    Q9HC56    Asn-368
• VTINVMDVNDNSPVVISPPSNTSFK (25aa)
  •    Q9HC56    Asn-664
• LVVNISDLGYPK (12aa)
  •    Q9HC56    Asn-754