Cadherin-13

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• Cadherin-13 / Homo sapiens    P55290

Source

• Blood Serum (UBERON_0001977)  

Reported structure

Composition

• Hex:5 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1729.5702 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2387.1936 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2589.3605 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:3 (avg mass : 2880.6184 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2792.5555 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2938.6985 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2954.6979 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 3246.9839 )
• Hex:8 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2362.1404 )

Disease

• Prostate cancer (DOID:10283)

Reference

• Large-scale intact glycopeptide identification by Mascot database search (2018 - Ravi Chand Bollineni, Christian Jeffrey Koehler, Randi Elin Gislefoss, Jan Haug Anonsen, Bernd Thiede) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Cadherin-13 / Homo sapiens
  •        Asn-86
  •        Asn-382
  •        Asn-598
  •        Asn-638
  •        Asn-654

Mass spectrometry observed peptide

• NITAVGK (7aa)
  •    P55290    Asn-86
• EFQATVEEGAVGVIVNLTVEDK (22aa)
  •    P55290    Asn-382
• NLSVVILGASDK (12aa)
  •    P55290    Asn-598
• INNTHALVSLLQNLNK (16aa)
  •    P55290    Asn-638
• ANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLR (24aa)
  •    P55290    Asn-654