Alpha-1-antichymotrypsin

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• Alpha-1-antichymotrypsin / Homo sapiens    P01011

Source

• Blood Plasma (UBERON_0001969)  
• Blood Serum (UBERON_0001977)  
• Mammary Gland (UBERON_0001911)  
• Urine (UBERON_0001088)  

Reported structure

• N-Linked / Complex / NeuAc(?2-?)Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-3)[NeuAc(?2-?)Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc
• N-Linked / Complex / NeuAc(a2-6)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-3)[NeuAc(a2-6)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc
• N-Linked / Complex / NeuAc(a2-6)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)[Gal(b1-4)GlcNAc(b1-4)]Man(a1-3)[NeuAc(a2-6)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc
• N-Linked / Complex / NeuAc(a2-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-4)[NeuAc(a2-6)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)]Man(a1-3)[NeuAc(a2-6)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc
• N-Linked / Complex / Structure 3629

Composition

• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 1974.8459 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2266.1038 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2178.0409 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2589.3605 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:3 (avg mass : 2880.6184 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 NeuGc:1 (avg mass : 3042.7608 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2590.3886 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2881.6465 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:1
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:2
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:4 NeuAc:1
• Hex:6 HexNAc:6 (avg mass : 2210.0397 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2897.6459 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2663.44 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2954.6979 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:3 (avg mass : 3245.9558 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:4 (avg mass : 3537.2137 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3100.8409 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3392.0988 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:4 (avg mass : 3683.3567 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:1
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:2
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:3
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:4 (avg mass : 3829.4997 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:4 NeuAc:1
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )

Disease

• Cancer, breast (DOID:1612)
• Esophageal cancer (DOID:5041)
• Prostate cancer (DOID:10283)

Reference

• Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018 - Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang) / Status : Unreviewed
• Site-Specific Profiling of Serum Glycoproteins Using N-Linked Glycan and Glycosite Analysis Revealing Atypical N-Glycosylation Sites on Albumin and α-1B-Glycoprotein (2018 - Shisheng Sun, Yingwei Hu, Li Jia, Shadi Toghi Eshghi, Yang Liu, Punit Shah, Hui Zhang) / Status : Unreviewed
• Large-scale intact glycopeptide identification by Mascot database search (2018 - Ravi Chand Bollineni, Christian Jeffrey Koehler, Randi Elin Gislefoss, Jan Haug Anonsen, Bernd Thiede) / Status : Unreviewed
• Distinct urinary glycoprotein signatures in prostate cancer patients (2018 - Rebeca Kawahara, Fabio Ortega, Livia Rosa-Fernandes, Vanessa Guimarães, Daniel Quina, Willian Nahas, Veit Schwämmle, Miguel Srougi, Katia R.M. Leite, Morten Thaysen-Andersen, Martin R. Larsen and Giuseppe Palmisano) / Status : Unreviewed
• Selective glycopeptide profiling by acetone enrichment and LC/MS (2014 - Takakura D, Harazono A, Hashii N, Kawasaki N) / Status : Reviewed
• Computational framework for identification of intact glycopeptides in complex samples (2014 - Mayampurath A, Yu CY, Song E, Balan J, Mechref Y, Tang H.) / Status : Reviewed
• Structure determination of the glycans of human-serum alpha 1-antichymotrypsin using 1H-NMR spectroscopy and deglycosylation by N-glycanase. (1991 - Laine A, Hachulla E, Strecker G, Michalski J, Wieruszeski J) / Status : Reviewed

Reported glycosite

• Alpha-1-antichymotrypsin / Homo sapiens
  •        Undefined site
  •        Asn-93
  •        Asn-106
  •        Asn-127
  •        Asn-186
  •        Asn-271

Mass spectrometry observed peptide

• NVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILK (30aa)
  •    P01011    Asn-93
• ALAFLSLGAHNTTLTEILK (19aa)
  •    P01011    Asn-93
• LSLGAHNTTLTEILK (15aa)
  •    P01011    Asn-93
• SLGAHNTTLTEILK (14aa)
  •    P01011    Asn-93
• FNLTETSEAEIHQSFQHLLR (20aa)
  •    P01011    Asn-106
• FNITETSEAEIHQSFQHIIR (20aa)
  •    P01011    Asn-106
• TLNQSSDELQLSMGN (15aa)
  •    P01011    Asn-127
• TLNQSSDELQLSMGNAMFVK (20aa)
  •    P01011    Asn-127
• TINQSSDEIQISMGNAMFVK (20aa)
  •    P01011    Asn-127
• LINDYVKNGTR (11aa)
  •    P01011    Asn-186
• YTGNASALF (9aa)
  •    P01011    Asn-271
• YTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLK (30aa)
  •    P01011    Asn-271
• YTGNASALFILPDQDK (16aa)
  •    P01011    Asn-271