Laminin subunit beta-1

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• Laminin subunit beta-1 / Homo sapiens    P07942

Source

• Blood Serum (UBERON_0001977)  
• Mammary Gland (UBERON_0001911)  

Reported structure

Composition

• Hex:3 HexNAc:6 (avg mass : 1723.6125 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:3 (avg mass : 1714.5989 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2135.9602 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2678.4515 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2881.6465 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2736.5316 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:3 (avg mass : 3083.8134 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2938.6985 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 3084.8415 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3100.8409 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:3 (avg mass : 3538.2418 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:4 (avg mass : 3829.4997 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
• Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )

Disease

• Cancer, breast (DOID:1612)
• Prostate cancer (DOID:10283)

Reference

• Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018 - Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang) / Status : Unreviewed
• Large-scale intact glycopeptide identification by Mascot database search (2018 - Ravi Chand Bollineni, Christian Jeffrey Koehler, Randi Elin Gislefoss, Jan Haug Anonsen, Bernd Thiede) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Laminin subunit beta-1 / Homo sapiens
  •        Asn-330
  •        Asn-677
  •        Asn-1041
  •        Asn-1279
  •        Asn-1336
  •        Asn-1542

Mass spectrometry observed peptide

• NSNACK (6aa)
  •    P07942    Asn-330
• GTNYTVR (7aa)
  •    P07942    Asn-677
• CVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDK (22aa)
  •    P07942    Asn-1041
• LSDTTSQSNSTAK (13aa)
  •    P07942    Asn-1279
• VNASTTEPNSTVEQSALMR (19aa)
  •    P07942    Asn-1336
• MEMPSTPQQLQNLTEDIR (18aa)
  •    P07942    Asn-1542