Integrin beta-1

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• Integrin beta-1 / Homo sapiens    P05556

Source

• Mammary Gland (UBERON_0001911)  

Reported structure

Composition

• Hex:3 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1406.3135 )
• Hex:3 HexNAc:6 (avg mass : 1723.6125 )
• Hex:4 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1219.1179 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1713.5708 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:3 (avg mass : 1714.5989 )
• Hex:4 HexNAc:6 (avg mass : 1885.7549 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1381.2603 )
• Hex:5 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1729.5702 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1730.5983 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:3 (avg mass : 1876.7413 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:4 (avg mass : 2226.0793 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:5 HexNAc:6 (avg mass : 2047.8973 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2242.0787 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:3 (avg mass : 2880.6184 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2299.1307 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2736.5316 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:4 (avg mass : 2591.4167 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:6 (avg mass : 2372.1821 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2664.4681 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:4 (avg mass : 2956.7541 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:4 NeuAc:1 (avg mass : 3248.012 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:4 NeuAc:2 (avg mass : 3539.2699 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:8 HexNAc:7 NeuAc:1 (avg mass : 3028.7774 )
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2883.6625 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
• Hex:9 HexNAc:8 NeuAc:1 (avg mass : 3394.1148 )
• Hex:9 HexNAc:8 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 3540.2578 )
• Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )

Disease

• Cancer, breast (DOID:1612)

Reference

• Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018 - Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Integrin beta-1 / Homo sapiens
  •        Asn-50
  •        Asn-212
  •        Asn-406
  •        Asn-481
  •        Asn-520
  •        Asn-669

Mass spectrometry observed peptide

• CGWCTNSTFLQEGMPTSAR (19aa)
  •    P05556    Asn-50
• SCGECIQAGPNCGWCTNSTFIQEGMPTSAR (30aa)
  •    P05556    Asn-50
• NPCTSEQNCTSPF (13aa)
  •    P05556    Asn-212
• LRNPCTSEQNCTSPFSYK (18aa)
  •    P05556    Asn-212
• TSEQNCTSPFSYK (13aa)
  •    P05556    Asn-212
• LRNPCTSEQNCTSPF (15aa)
  •    P05556    Asn-212
• NPCTSEQNCTSPFSYK (16aa)
  •    P05556    Asn-212
• NGVNGTGENGRK (12aa)
  •    P05556    Asn-406
• CHEGNGTFECGACR (14aa)
  •    P05556    Asn-481
• KENSSEICSN (10aa)
  •    P05556    Asn-520
• ENSSEICSNNGECVCGQCVCR (21aa)
  •    P05556    Asn-520
• KENSSEICSNNGECVCGQCVCR (22aa)
  •    P05556    Asn-520
• KDTCTQECSYFNITK (15aa)
  •    P05556    Asn-669
• DTCTQECSYFNITK (14aa)
  •    P05556    Asn-669