Integrin alpha-6

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• Integrin alpha-6 / Homo sapiens    P23229

Source

• Mammary Gland (UBERON_0001911)  

Reported structure

Composition

• Hex:3 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 1899.7383 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:3 (avg mass : 1714.5989 )
• Hex:4 HexNAc:6 (avg mass : 1885.7549 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1730.5983 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1892.7407 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:6 (avg mass : 2372.1821 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )

Disease

• Cancer, breast (DOID:1612)

Reference

• Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018 - Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Integrin alpha-6 / Homo sapiens
  •        Asn-323
  •        Asn-770
  •        Asn-966
  •        Asn-997

Mass spectrometry observed peptide

• ANHSGAVVLLK (11aa)
  •    P23229    Asn-323
• QISCVANQNGSQADCEIGNPFKR (23aa)
  •    P23229    Asn-770
• QLSCVANQNGSQADCELGNPFK (22aa)
  •    P23229    Asn-770
• ANQNGSQADCELGNPFK (17aa)
  •    P23229    Asn-770
• YQTINCSVNVNCVNIR (16aa)
  •    P23229    Asn-966
• KYQTINCSVNVNCVNIR (17aa)
  •    P23229    Asn-966
• IWNSTFIEEYSK (12aa)
  •    P23229    Asn-997