GlyConnect

Taxonomy (1) Protein (1) Source (1) Structure (0) Composition (29) Disease (1) Site (6) Peptide (6)

Taxonomy

Homo sapiens (Human)

Protein

Integrin alpha-2 / Homo sapiens P17301

Source

Mammary Gland (UBERON_0001911)

Reported structure

Composition

Disease

Cancer, breast (DOID:1612)

Reported glycosite

Integrin alpha-2 / Homo sapiens :
- Asn-105
- Asn-112
- Asn-343
- Asn-699
- Asn-1057
- Asn-1074

Mass spectrometry validated peptide

INIQTSTSIPNVTEMK (16aa)
- P17301 Asn-105
TNMSIGIIITR (11aa)
- P17301 Asn-112
YFFNVSDEAAIIEK (14aa)
- P17301 Asn-343
QNNQVAIVYNITLDADGFSSR (21aa)
- P17301 Asn-699
TASCSNVTCWIK (12aa)
- P17301 Asn-1057
GEYFVNVTTR (10aa)
- P17301 Asn-1074

- Hex:8 HexNAc:7 NeuAc:1
- Hex:6 HexNAc:3 (avg mass : 1600.4547 )
- Hex:4 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1568.4559 )
- Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2897.6459 )
- Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )
- Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
- Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
- Hex:4 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2178.0409 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
- Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
- Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
- Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:4
- Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2062.9088 )
- Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
- Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
- Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:1
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:2
- Hex:4 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1567.4278 )

Protein and gene references

UniProtKB : P17301

neXtProt : NX_P17301

GeneCards : ITGA2

3D structure from PDB

Select a PDB entry

Github Wiki

3D visualization by LiteMol

References (1)

Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018)
Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang
Pubmed : 29741879 DOI : 10.1021/acs.analchem.8b01137
Status : Unreviewed