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Taxonomy (1) Protein (1) Source (1) Structure (0) Composition (42) Disease (1) Site (4) Peptide (5)

Taxonomy

Homo sapiens (Human)

Protein

Golgi apparatus protein 1 / Homo sapiens Q92896

Source

Mammary Gland (UBERON_0001911)

Reported structure

Composition

Disease

Cancer, breast (DOID:1612)

Reported glycosite

Golgi apparatus protein 1 / Homo sapiens :
- Asn-165
- Asn-210
- Asn-581
- Asn-786

Mass spectrometry validated peptide

LNLTTDPK (8aa)
- Q92896 Asn-165
GNITEYQCHQYITK (14aa)
- Q92896 Asn-210
ICHTHGWNETSEFMPQGAVFSCIYR (25aa)
- Q92896 Asn-581
VDVVICLSTTVRNDTLQEAK (20aa)
- Q92896 Asn-786
NDTLQEAK (8aa)
- Q92896 Asn-786

- Hex:6 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2242.0787 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:4
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
- Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )
- Hex:5 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1730.5983 )
- Hex:4 HexNAc:9
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:3
- Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2411.2187 )
- Hex:6 HexNAc:7 (avg mass : 2413.2347 )
- Hex:7 HexNAc:6 (avg mass : 2372.1821 )
- Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
- Hex:3 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 1899.7383 )
- Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2663.44 )
- Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
- Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:2
- Hex:5 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1729.5702 )
- Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2265.0757 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2266.1038 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2120.9889 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 1917.7939 )
- Hex:6 HexNAc:6 (avg mass : 2210.0397 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2307.1564 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2428.2462 )
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2037.8556 )
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1746.5977 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1771.6509 )
- Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
- Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
- Hex:5 HexNAc:3 dHex:3
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:3 (avg mass : 2162.0415 )
- Hex:4 HexNAc:6 (avg mass : 1885.7549 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2452.2713 )
- Hex:3 HexNAc:9 (avg mass : 2333.1975 )

Protein and gene references

UniProtKB : Q92896

neXtProt : NX_Q92896

GeneCards : GLG1

GlycoDomain : Q92896

3D structure from PDB

Either no PDB or existing PDB of non-glycosylated form

References (1)

Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018)
Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang
Pubmed : 29741879 DOI : 10.1021/acs.analchem.8b01137
Status : Unreviewed