GlyConnect

Taxonomy (1) Protein (1) Source (1) Structure (0) Composition (69) Disease (1) Site (3) Peptide (10)

Taxonomy

Homo sapiens (Human)

Protein

Decorin / Homo sapiens P07585

Source

Mammary Gland (UBERON_0001911)

Reported structure

Composition

Disease

Cancer, breast (DOID:1612)

Reported glycosite

Decorin / Homo sapiens :
- Asn-211
- Asn-262
- Asn-303

Mass spectrometry validated peptide

IADTNITSIPQGIPPSITEIHIDGNK (26aa)
- P07585 Asn-211
IADTNITSIPQGLPPSLTELHLDGNK (26aa)
- P07585 Asn-211
IGISFNSISAVDNGSIANTPHIR (23aa)
- P07585 Asn-262
GLSFNSISAVDNGSLANTPHLR (22aa)
- P07585 Asn-262
LGLSFNSISAVDNGSLANTPH (21aa)
- P07585 Asn-262
SISAVDNGSLANTPHLR (17aa)
- P07585 Asn-262
SFNSISAVDNGSLANTPHLR (20aa)
- P07585 Asn-262
YIQVVYLHNNNISVVGSSDFCPPGHNTK (28aa)
- P07585 Asn-303
VYLHNNNISVVGSSDFCPPGHNTK (24aa)
- P07585 Asn-303
LHNNNISVVGSSDFCPPGHNTK (22aa)
- P07585 Asn-303

- Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
- Hex:6 HexNAc:5 (avg mass : 2006.8447 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2062.9088 )
- Hex:4 HexNAc:4 (avg mass : 1479.3649 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2411.2187 )
- Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
- Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
- Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1754.6234 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:2
- Hex:3 HexNAc:3 (avg mass : 1114.0275 )
- Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
- Hex:6 HexNAc:4 (avg mass : 1803.6497 )
- Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
- Hex:4 HexNAc:5 (avg mass : 1682.5599 )
- Hex:4 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1770.6228 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
- Hex:4 HexNAc:9
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1746.5977 )
- Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
- Hex:5 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1730.5983 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
- Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2427.2181 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1916.7658 )
- Hex:5 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1729.5702 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2590.3886 )
- Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 1869.7555 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
- Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
- Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
- Hex:4 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1567.4278 )
- Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
- Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
- Hex:4 HexNAc:3 (avg mass : 1276.1699 )
- Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2120.9889 )
- Hex:4 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1568.4559 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3100.8409 )
- Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1713.5708 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
- Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 1974.8459 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
- Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2135.9602 )
- Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2589.3605 )
- Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2485.2982 )
- Hex:6 HexNAc:3 (avg mass : 1600.4547 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
- Hex:4 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2178.0409 )
- Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )
- Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
- Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
- Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 1973.8178 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2266.1038 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 1917.7939 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2136.9883 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )

Protein and gene references

UniProtKB : P07585

neXtProt : NX_P07585

GeneCards : DCN

3D structure from PDB

Either no PDB or existing PDB of non-glycosylated form

References (1)

Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018)
Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang
Pubmed : 29741879 DOI : 10.1021/acs.analchem.8b01137
Status : Unreviewed