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  • CD63 antigen

CD63 antigen

Taxonomy : Homo sapiens

SNFG, Text, Oxford
Taxonomy (1) Protein (1) Source (1) Structure (0) Composition (16) Disease (1) Site (3) Peptide (5)

    Taxonomy

  • Homo sapiens (Human)

    Protein

  • CD63 antigen / Homo sapiens    P08962

    Source

  • Mammary Gland (UBERON_0001911)  

    Reported structure

    Composition

  • Hex:6 HexNAc:3 dHex:3
  • Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
  • Hex:6 HexNAc:3 dHex:2
  • Hex:4 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2178.0409 )
  • Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
  • Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
  • Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
  • Hex:7 HexNAc:6 dHex:4
  • Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1713.5708 )
  • Hex:4 HexNAc:3 dHex:3
  • Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
  • Hex:5 HexNAc:4 dHex:4
  • Hex:5 HexNAc:3 dHex:3
  • Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
  • Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2037.8556 )
  • Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )

    Disease

  • Cancer, breast (DOID:1612)

    Reported glycosite

  • CD63 antigen / Homo sapiens :
    •        Asn-130
    •        Asn-150
    •        Asn-172

    Mass spectrometry validated peptide

  • NNHTASIIDR (10aa)
    •    P08962    Asn-130
  • CCGAANYTDWEK (12aa)
    •    P08962    Asn-150
  • GAANYTDWEK (10aa)
    •    P08962    Asn-150
  • NRVPDSCCINVTVGCGINFNEK (22aa)
    •    P08962    Asn-172
  • VPDSCCINVTVGCGINFNEK (20aa)
    •    P08962    Asn-172
  • 5 x 4 x 3 x
    • Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
    • Site (1) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-150
  • 5 x 3 x 3 x
    • Hex:5 HexNAc:3 dHex:3
    • Site (2) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-130
        •        Asn-172
  • 3 x 3 x 1 x
    • Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
    • Site (1) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-130
  • 6 x 3 x 3 x
    • Hex:6 HexNAc:3 dHex:3
    • Site (3) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-130
        •        Asn-150
        •        Asn-172
  • 7 x 6 x 4 x
    • Hex:7 HexNAc:6 dHex:4
    • Site (1) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-150
  • 5 x 4 x 4 x
    • Hex:5 HexNAc:4 dHex:4
    • Site (1) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-130
  • 8 x 2 x
    • Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
    • Site (1) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-130
  • 3 x 2 x 1 x
    • Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
    • Site (2) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-130
        •        Asn-150
  • 6 x 3 x 1 x 1 x
    • Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2037.8556 )
    • Site (1) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-130
  • 4 x 6 x 2 x
    • Hex:4 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2178.0409 )
    • Site (1) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-150
  • 6 x 3 x 2 x
    • Hex:6 HexNAc:3 dHex:2
    • Site (1) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-172
  • 4 x 3 x 1 x 1 x
    • Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1713.5708 )
    • Site (1) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-150
  • 4 x 3 x 3 x
    • Hex:4 HexNAc:3 dHex:3
    • Site (1) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-172
  • 6 x 5 x 3 x
    • Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
    • Site (1) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-150
  • 4 x 6 x 1 x
    • Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
    • Site (1) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-130
  • 6 x 3 x 1 x
    • Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
    • Site (3) Suggested Structure (0)

        Suggested structure

        Reported glycosite

      • CD63 antigen / Homo sapiens :
        •        Asn-130
        •        Asn-150
        •        Asn-172

Protein and gene references

UniProtKB : P08962

neXtProt : NX_P08962

GeneCards : CD63

3D structure from PDB

Either no PDB or existing PDB of non-glycosylated form

References (1)

Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018)
Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang
Pubmed : 29741879   DOI : 10.1021/acs.analchem.8b01137
Status : Unreviewed

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