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Taxonomy (1) Protein (1) Source (1) Structure (0) Composition (92) Disease (1) Site (2) Peptide (9)

Taxonomy

Homo sapiens (Human)

Protein

Biglycan / Homo sapiens P21810

Source

Mammary Gland (UBERON_0001911)

Reported structure

Composition

Disease

Cancer, breast (DOID:1612)

Reported glycosite

Biglycan / Homo sapiens :
- Asn-270
- Asn-311

Mass spectrometry validated peptide

- Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
- Hex:4 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2468.2707 )
- Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1713.5708 )
- Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2501.2976 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2573.3611 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2062.9088 )
- Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2428.2462 )
- Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2194.0403 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2411.2187 )
- Hex:4 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1770.6228 )
- Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2485.2982 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2664.4681 )
- Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
- Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
- Hex:4 HexNAc:6 (avg mass : 1885.7549 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
- Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
- Hex:4 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2235.0929 )
- Hex:4 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 2641.4829 )
- Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
- Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2120.9889 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2242.0787 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2266.1038 )
- Hex:4 HexNAc:7 (avg mass : 2088.9499 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2161.0134 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
- Hex:7 HexNAc:6 (avg mass : 2372.1821 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
- Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2356.1827 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3100.8409 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
- Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2897.6459 )
- Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 1869.7555 )
- Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1754.6234 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2307.1564 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2452.2713 )
- Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2265.0757 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1916.7658 )
- Hex:5 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2340.1833 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 1974.8459 )
- Hex:6 HexNAc:5 (avg mass : 2006.8447 )
- Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
- Hex:5 HexNAc:5 (avg mass : 1844.7023 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
- Hex:3 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 1899.7383 )
- Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2647.4406 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3392.0988 )
- Hex:5 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1729.5702 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
- Hex:5 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1730.5983 )
- Hex:3 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 2479.3405 )
- Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
- Hex:6 HexNAc:6 (avg mass : 2210.0397 )
- Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2427.2181 )
- Hex:6 HexNAc:3 (avg mass : 1600.4547 )
- Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2135.9602 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1771.6509 )
- Hex:7 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 2111.9351 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2136.9883 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2590.3886 )
- Hex:3 HexNAc:7 (avg mass : 1926.8075 )
- Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:1
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2299.1307 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2015.8985 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 1917.7939 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )
- Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
- Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
- Hex:4 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2178.0409 )
- Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
- Hex:5 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 2600.4303 )
- Hex:8 HexNAc:7 (avg mass : 2737.5195 )
- Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2663.44 )
- Hex:6 HexNAc:4 (avg mass : 1803.6497 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:4
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2283.1313 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )

Protein and gene references

UniProtKB : P21810

neXtProt : NX_P21810

GeneCards : BGN

3D structure from PDB

Either no PDB or existing PDB of non-glycosylated form

References (1)

Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018)
Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang
Pubmed : 29741879 DOI : 10.1021/acs.analchem.8b01137
Status : Unreviewed