GlyConnect

Taxonomy (1) Protein (1) Tissue (1) Structure (0) Composition (46) Disease (1) Site (1) Peptide (1)

Taxonomy

Homo sapiens (Human)

Protein

Asporin / Homo sapiens Q9BXN1

Tissue

Exocrine System > Exocrine Gland > Mammary > Primary or metastatic breast tumors

Reported structure

Composition

Disease

Cancer, breast

Reported glycosite

Asporin / Homo sapiens :
- Asn-282 (46 structures)

Mass spectrometry validated peptide

ITDIENGSIANIPR (14aa)
- Q9BXN1 Asn-282

- Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2590.3886 )
- Hex:7 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 2111.9351 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:2
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2136.9883 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2411.2187 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2452.2713 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
- Hex:5 HexNAc:5 (avg mass : 1844.7023 )
- Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2194.0403 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2161.0134 )
- Hex:4 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1770.6228 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 1974.8459 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
- Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2135.9602 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 1869.7555 )
- Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
- Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )
- Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2428.2462 )
- Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
- Hex:6 HexNAc:4 (avg mass : 1803.6497 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
- Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2501.2976 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2062.9088 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3100.8409 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
- Hex:3 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 1899.7383 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1916.7658 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1771.6509 )
- Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1754.6234 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2015.8985 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
- Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2485.2982 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
- Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
- Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )

Protein and gene references

UniProtKB : Q9BXN1

neXtProt : NX_Q9BXN1

GeneCards : ASPN

3D structure from PDB

Either no PDB or existing PDB of non-glycosylated form

References (1)

Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018)
Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang
Pubmed : 29741879 DOI : 10.1021/acs.analchem.8b01137
Status : Unreviewed