GENFTETDIK (10aa)

Taxonomy

• Ovis aries (Sheep)

Protein

• Major prion protein (VRQ/VRQ polymorphism) 21K slow variant / Ovis aries    Q712V9
• Major prion protein (VRQ/VRQ polymorphism) CH1641 variant / Ovis aries    Q712V9

Source

• Brain (UBERON_0000955)  

Reported structure

• N-Linked / Complex / Structure 9983
• N-Linked / Complex / Structure 9990
• N-Linked / Complex / Structure 9939
• N-Linked / Complex / Structure 9973
• N-Linked / Complex / Structure 9952
• N-Linked / Complex / Structure 9971
• N-Linked / Complex / Structure 9954
• N-Linked / Complex / Structure 9956
• N-Linked / Complex / Structure 9980
• N-Linked / Complex / Structure 9917
• N-Linked / Complex / Structure 9944
• N-Linked / Complex / Structure 9923
• N-Linked / Complex / Structure 9987
• N-Linked / Complex / Structure 9961
• N-Linked / Complex / Structure 9919
• N-Linked / Complex / Structure 9966
• N-Linked / Complex / Structure 9945
• N-Linked / Complex / Structure 9940
• N-Linked / Complex / Structure 9963
• N-Linked / Complex / Structure 9926
• N-Linked / Complex / Structure 9984
• N-Linked / Complex / Structure 9964
• N-Linked / Complex / Structure 9934
• N-Linked / Complex / Structure 9948
• N-Linked / Complex / Structure 9942
• N-Linked / Complex / Structure 9962
• N-Linked / Complex / Structure 9957
• N-Linked / Complex / Structure 9949
• N-Linked / Complex / Structure 9977
• N-Linked / Complex / Structure 9985
• N-Linked / Complex / Structure 9936
• N-Linked / Complex / Structure 9938
• N-Linked / Complex / Structure 9931
• N-Linked / Complex / Structure 9922
• N-Linked / Hybrid / Structure 9953

Composition

• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 1974.8459 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2323.1558 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2428.2462 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2283.1313 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2776.5561 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3067.814 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2340.1833 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2631.4412 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2922.6991 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:3 (avg mass : 3213.957 )
• Hex:5 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2979.7511 )
• Hex:5 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3271.009 )
• Hex:5 HexNAc:7 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2834.6362 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:3 (avg mass : 3172.9044 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:2 (avg mass : 3027.7895 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2793.5836 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 3084.8415 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:3 (avg mass : 3376.0994 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 (avg mass : 2648.4687 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2939.7266 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 NeuAc:2 (avg mass : 3230.9845 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 NeuAc:3 (avg mass : 3522.2424 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3433.1514 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2996.7786 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 3288.0365 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:2 NeuAc:3 (avg mass : 3579.2944 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 3142.9216 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:3 NeuAc:2 (avg mass : 3434.1795 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:2 NeuAc:3 (avg mass : 3741.4368 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 3305.064 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:3 NeuAc:2 (avg mass : 3596.3219 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:3 NeuAc:3 (avg mass : 3887.5798 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:4 NeuAc:1 (avg mass : 3451.207 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:4 NeuAc:2 (avg mass : 3742.4649 )
• Hex:9 HexNAc:4 dHex:3 NeuAc:2 (avg mass : 3311.0217 )

Disease

• Scrapie (DOID:5434)

Reference

• Site-specific analysis of N-glycans from different sheep prion strains (2021 - Natali Nakić ,Thanh Hoa Tran ,Mislav Novokmet,Olivier Andreoletti,Gordan Lauc,Giuseppe Legname) / Status : Reviewed

Reported glycosite

• Major prion protein (VRQ/VRQ polymorphism) 21K slow variant / Ovis aries
  •        Asn-200
• Major prion protein (VRQ/VRQ polymorphism) CH1641 variant / Ovis aries
  •        Asn-200

Mass spectrometry observed peptide

• GENFTETDIK (10aa)
  •    Q712V9    Asn-200     Major prion protein (VRQ/VRQ polymorphism) CH1641 variant / Ovis aries
  •    Q712V9    Asn-200     Major prion protein (VRQ/VRQ polymorphism) 21K slow variant / Ovis aries