YHKNNKSWMESEF (13aa)

Taxonomy

• Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)

Protein

• Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)    P0DTC2

Source

• FreeStyle 293-F (CVCL_D603)  

Reported structure

Composition

• Hex:3 HexNAc:3 (avg mass : 1114.0275 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1957.8184 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2015.8985 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:3 (avg mass : 2162.0415 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1916.7658 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1771.6509 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 1974.8459 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2266.1038 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
• Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2371.1942 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2283.1313 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2485.2982 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 (avg mass : 2648.4687 )
• Hex:7 HexNAc:6 (avg mass : 2372.1821 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )

Disease

• COVID-19 (DOID:0080600)

Reference

• Site-specific glycan analysis of the SARS-CoV-2 spike (2020 - Yasunori Watanabe, Joel D. Allen, Daniel Wrapp, Jason S. McLellan, Max Crispin) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
  •        Asn-149

Mass spectrometry observed peptide

• YHKNNKSWMESEF (13aa)
  •    P0DTC2    Asn-149