QCVNLTTR (8aa)

Taxonomy

• Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)

Protein

• Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) - DRAFT DATA / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)    P0DTC2
• Recombinant Spike glycoprotein (HEK293) - DRAFT DATA / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)    P0DTC2

Source

• FreeStyle 293-F (CVCL_D603)  
• HEK293 (CVCL_0045)  

Reported structure

Composition

• HexNAc:1 (avg mass : 221.2103 )
• HexNAc:2 (avg mass : 424.4053 )
• Hex:1 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 732.6907 )
• Hex:3 HexNAc:2 (avg mass : 910.8325 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
• Hex:3 HexNAc:3 (avg mass : 1114.0275 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
• Hex:3 HexNAc:4 (avg mass : 1317.2225 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1609.5085 )
• Hex:3 HexNAc:5 (avg mass : 1520.4175 )
• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1957.8184 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 1869.7555 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2015.8985 )
• Hex:3 HexNAc:9 (avg mass : 2333.1975 )
• Hex:4 HexNAc:2 (avg mass : 1072.9749 )
• Hex:4 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1219.1179 )
• Hex:4 HexNAc:3 (avg mass : 1276.1699 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1713.5708 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1916.7658 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1771.6509 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 1974.8459 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2266.1038 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2178.0409 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
• Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:5 HexNAc:5 (avg mass : 1844.7023 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2136.9883 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2194.0403 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2485.2982 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2340.1833 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:3 (avg mass : 1600.4547 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1746.5977 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2037.8556 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2590.3886 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:1
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2356.1827 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 (avg mass : 2648.4687 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )

Disease

• COVID-19 (DOID:0080600)

Reference

• Site-specific analysis of the SARS-CoV-2 glycan shield (2020 - Yasunori Watanabe, Joel D. Allen, Daniel Wrapp, Jason S. McLellan, Max Crispin) / Status : Unreviewed
• Deducing the N- and O- glycosylation profile of the spike protein of novel coronavirus SARS-CoV-2 (2020 - Asif Shajahan, Nitin T. Supekar, Anne S. Gleinich, Parastoo Azadi) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) - DRAFT DATA / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
  •        Asn-17
• Recombinant Spike glycoprotein (HEK293) - DRAFT DATA / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
  •        Asn-17

Mass spectrometry observed peptide

• QCVNLTTR (8aa)
  •    P0DTC2    Asn-17
• QCVNLTTR (8aa)
  •    P0DTC2    Asn-17