FPNITNLCPFGE (12aa)

Taxonomy

• Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)

Protein

• Recombinant Spike glycoprotein (BTI-Tn-5B1-4) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)    P0DTC2
• Recombinant Spike glycoprotein (HEK293) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)    P0DTC2

Source

• BTI-Tn-5B1-4 (CVCL_C190)  
• HEK293 (CVCL_0045)  

Reported structure

Composition

• HexNAc:1 (avg mass : 221.2103 )
• HexNAc:1 dHex:1 (avg mass : 367.3533 )
• Hex:2 HexNAc:2 (avg mass : 748.6901 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 894.8331 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1040.9761 )
• Hex:3 HexNAc:2 (avg mass : 910.8325 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1203.1185 )
• Hex:3 HexNAc:3 (avg mass : 1114.0275 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
• Hex:3 HexNAc:4 (avg mass : 1317.2225 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 1869.7555 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2161.0134 )
• Hex:3 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2072.9505 )
• Hex:3 HexNAc:9 (avg mass : 2333.1975 )
• Hex:3 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 2479.3405 )
• Hex:4 HexNAc:2 (avg mass : 1072.9749 )
• Hex:4 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1219.1179 )
• Hex:4 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1365.2609 )
• Hex:4 HexNAc:3 (avg mass : 1276.1699 )
• Hex:4 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1567.4278 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
• Hex:4 HexNAc:4 (avg mass : 1479.3649 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1916.7658 )
• Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 1973.8178 )
• Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2265.0757 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2411.2187 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
• Hex:4 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 2641.4829 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
• Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:5 (avg mass : 1844.7023 )
• Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2135.9602 )
• Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2427.2181 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2573.3611 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2194.0403 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2485.2982 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2776.5561 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:3 (avg mass : 1600.4547 )
• Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1746.5977 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2037.8556 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2589.3605 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:3 (avg mass : 2880.6184 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2501.2976 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2792.5555 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2356.1827 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2647.4406 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2938.6985 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2559.3777 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2897.6459 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2663.44 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2954.6979 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3100.8409 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3392.0988 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2721.5201 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3304.0359 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:8 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2825.5824 )
• Hex:8 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2971.7254 )
• Hex:8 HexNAc:7 (avg mass : 2737.5195 )
• Hex:8 HexNAc:7 NeuAc:1 (avg mass : 3028.7774 )
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2883.6625 )
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 3174.9204 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
• Hex:9 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3425.1257 )
• Hex:9 HexNAc:8 (avg mass : 3102.8569 )

Disease

• COVID-19 (DOID:0080600)

Reference

• Site-specific N-glycosylation Characterization of Recombinant SARS-CoV-2 Spike Proteins using High-Resolution Mass Spectrometry (2020 - Yong Zhang, Wanjun Zhao, Yonghong Mao, Shisheng Wang, Yi Zhong, Tao Su, Meng Gong, Xiaofeng Lu, Jingqiu Cheng, Hao Yang) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Recombinant Spike glycoprotein (BTI-Tn-5B1-4) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
  •        Asn-331
• Recombinant Spike glycoprotein (HEK293) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
  •        Asn-331

Mass spectrometry observed peptide

• FPNITNLCPFGE (12aa)
  •    P0DTC2    Asn-331
• FPNITNLCPFGE (12aa)
  •    P0DTC2    Asn-331