VYSSANNCTFE (11aa)

Taxonomy

• Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)

Protein

• Recombinant Spike glycoprotein (BTI-Tn-5B1-4) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)    P0DTC2
• Recombinant Spike glycoprotein (HEK293) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)    P0DTC2

Source

• BTI-Tn-5B1-4 (CVCL_C190)  
• HEK293 (CVCL_0045)  

Reported structure

Composition

• HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 570.5483 )
• Hex:1 HexNAc:2 (avg mass : 586.5477 )
• Hex:1 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 878.8337 )
• Hex:2 HexNAc:2 (avg mass : 748.6901 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 894.8331 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1040.9761 )
• Hex:3 HexNAc:2 (avg mass : 910.8325 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1203.1185 )
• Hex:3 HexNAc:3 (avg mass : 1114.0275 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1406.3135 )
• Hex:3 HexNAc:4 (avg mass : 1317.2225 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1957.8184 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 1869.7555 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2161.0134 )
• Hex:3 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2072.9505 )
• Hex:4 HexNAc:2 (avg mass : 1072.9749 )
• Hex:4 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1365.2609 )
• Hex:4 HexNAc:3 (avg mass : 1276.1699 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1713.5708 )
• Hex:4 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1770.6228 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1916.7658 )
• Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 1973.8178 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2411.2187 )
• Hex:4 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2177.0128 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
• Hex:4 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2235.0929 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
• Hex:5 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1729.5702 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1730.5983 )
• Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:5 (avg mass : 1844.7023 )
• Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2135.9602 )
• Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2427.2181 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2573.3611 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2194.0403 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2485.2982 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2776.5561 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:3 (avg mass : 1600.4547 )
• Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1746.5977 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2037.8556 )
• Hex:6 HexNAc:4 (avg mass : 1803.6497 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2589.3605 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:3 (avg mass : 2880.6184 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2501.2976 )
• Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2792.5555 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2356.1827 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2647.4406 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2938.6985 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3229.9564 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2559.3777 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:4 (avg mass : 1965.7921 )
• Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2315.1301 )
• Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2606.388 )
• Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2897.6459 )
• Hex:7 HexNAc:6 (avg mass : 2372.1821 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2663.44 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2954.6979 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:3 (avg mass : 3245.9558 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:4 (avg mass : 3537.2137 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3100.8409 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3392.0988 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:4 (avg mass : 3683.3567 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:5 NeuAc:4 (avg mass : 4267.9287 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2721.5201 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3304.0359 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3595.2938 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:8 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2825.5824 )
• Hex:8 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2971.7254 )
• Hex:8 HexNAc:7 (avg mass : 2737.5195 )
• Hex:8 HexNAc:7 NeuAc:1 (avg mass : 3028.7774 )
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2883.6625 )
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 3174.9204 )
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3466.1783 )
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3757.4362 )
• Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:4 (avg mass : 4048.6941 )
• Hex:8 HexNAc:8 (avg mass : 2940.7145 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
• Hex:9 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3425.1257 )
• Hex:9 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 3248.9999 )
• Hex:10 HexNAc:2 (avg mass : 2045.8293 )
• Hex:10 HexNAc:9 (avg mass : 3468.1943 )

Disease

• COVID-19 (DOID:0080600)

Reference

• Site-specific N-glycosylation Characterization of Recombinant SARS-CoV-2 Spike Proteins using High-Resolution Mass Spectrometry (2020 - Yong Zhang, Wanjun Zhao, Yonghong Mao, Shisheng Wang, Yi Zhong, Tao Su, Meng Gong, Xiaofeng Lu, Jingqiu Cheng, Hao Yang) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Recombinant Spike glycoprotein (BTI-Tn-5B1-4) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
  •        Asn-165
• Recombinant Spike glycoprotein (HEK293) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
  •        Asn-165

Mass spectrometry observed peptide

• VYSSANNCTFE (11aa)
  •    P0DTC2    Asn-165
• VYSSANNCTFE (11aa)
  •    P0DTC2    Asn-165