NHTSPDVDLGDISGINASVVNIQK (24aa)

Taxonomy

• Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)

Protein

• Recombinant Spike glycoprotein (BTI-Tn-5B1-4) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)    P0DTC2

Source

• BTI-Tn-5B1-4 (CVCL_C190)  

Reported structure

Composition

• HexNAc:1 (avg mass : 221.2103 )
• HexNAc:1 dHex:1 (avg mass : 367.3533 )
• HexNAc:1 dHex:2 (avg mass : 513.4963 )
• HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 570.5483 )
• HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 716.6913 )
• Hex:1 HexNAc:2 (avg mass : 586.5477 )
• Hex:1 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 732.6907 )
• Hex:1 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 878.8337 )
• Hex:2 HexNAc:2 (avg mass : 748.6901 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 894.8331 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1040.9761 )
• Hex:3 HexNAc:2 (avg mass : 910.8325 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1203.1185 )
• Hex:3 HexNAc:3 (avg mass : 1114.0275 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1406.3135 )
• Hex:3 HexNAc:4 (avg mass : 1317.2225 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
• Hex:4 HexNAc:2 (avg mass : 1072.9749 )
• Hex:4 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1365.2609 )
• Hex:4 HexNAc:3 (avg mass : 1276.1699 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1568.4559 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1381.2603 )
• Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1730.5983 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:4 (avg mass : 2226.0793 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2242.0787 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:4 NeuAc:2 (avg mass : 3539.2699 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
• Hex:10 HexNAc:2 (avg mass : 2045.8293 )

Disease

• COVID-19 (DOID:0080600)

Reference

• Site-specific N-glycosylation Characterization of Recombinant SARS-CoV-2 Spike Proteins using High-Resolution Mass Spectrometry (2020 - Yong Zhang, Wanjun Zhao, Yonghong Mao, Shisheng Wang, Yi Zhong, Tao Su, Meng Gong, Xiaofeng Lu, Jingqiu Cheng, Hao Yang) / Status : Unreviewed
• Identification of 22 N-glycosites on spike glycoprotein of SARS-CoV-2 and accessible surface glycopeptide motifs: Implications for vaccination and antibody therapeutics (2020 - Dapeng Zhou, Xiaoxu Tian, Ruibing Qi, Chao Peng, Wen Zhang) / Status : Reviewed

Reported glycosite

• Recombinant Spike glycoprotein (BTI-Tn-5B1-4) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
  •        Asn-1159
  •        Asn-1174

Mass spectrometry observed peptide

• NHTSPDVDLGDISGINASVVNIQK (24aa)
  •    P0DTC2    Asn-1159
• NHTSPDVDLGDISGINASVVNIQK (24aa)
  •    P0DTC2    Asn-1174