NHTSPDVDLGDISGINASVVNIQK (24aa)

Taxonomy

• Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)

Protein

• Recombinant Spike glycoprotein (BTI-Tn-5B1-4) - DRAFT DATA / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)    P0DTC2
• Recombinant Spike glycoprotein (HEK293) - DRAFT DATA / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)    P0DTC2

Source

• BTI-Tn-5B1-4 (CVCL_C190)  
• HEK293 (CVCL_0045)  

Reported structure

Composition

• HexNAc:1 (avg mass : 221.2103 )
• HexNAc:1 dHex:1 (avg mass : 367.3533 )
• HexNAc:1 dHex:2 (avg mass : 513.4963 )
• HexNAc:2 (avg mass : 424.4053 )
• HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 570.5483 )
• HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 716.6913 )
• Hex:1 HexNAc:2 (avg mass : 586.5477 )
• Hex:1 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 732.6907 )
• Hex:1 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 878.8337 )
• Hex:2 HexNAc:2 (avg mass : 748.6901 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 894.8331 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1040.9761 )
• Hex:3 HexNAc:2 (avg mass : 910.8325 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1203.1185 )
• Hex:3 HexNAc:3 (avg mass : 1114.0275 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1406.3135 )
• Hex:3 HexNAc:4 (avg mass : 1317.2225 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
• Hex:3 HexNAc:5 (avg mass : 1520.4175 )
• Hex:3 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 2276.1455 )
• Hex:4 HexNAc:2 (avg mass : 1072.9749 )
• Hex:4 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1365.2609 )
• Hex:4 HexNAc:3 (avg mass : 1276.1699 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1568.4559 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:4 HexNAc:6 (avg mass : 1885.7549 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2178.0409 )
• Hex:4 HexNAc:7 dHex:2
• Hex:4 HexNAc:8 (avg mass : 2292.1449 )
• Hex:4 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 2641.4829 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1381.2603 )
• Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1730.5983 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:4
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2136.9883 )
• Hex:5 HexNAc:8 (avg mass : 2454.2873 )
• Hex:5 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 2600.4303 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:3 (avg mass : 1600.4547 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
• Hex:6 HexNAc:5 (avg mass : 2006.8447 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2299.1307 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2356.1827 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 (avg mass : 2648.4687 )
• Hex:6 HexNAc:8 (avg mass : 2616.4297 )
• Hex:6 HexNAc:9
• Hex:6 HexNAc:9 dHex:1
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2315.1301 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:4 (avg mass : 3537.2137 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:4
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:4 NeuAc:2
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:5 (avg mass : 3102.8971 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2721.5201 )
• Hex:7 HexNAc:8
• Hex:7 HexNAc:10
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:8 HexNAc:5 (avg mass : 2331.1295 )
• Hex:8 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2477.2725 )
• Hex:8 HexNAc:5 dHex:4 (avg mass : 2915.7015 )
• Hex:8 HexNAc:8
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
• Hex:9 HexNAc:6 (avg mass : 2696.4669 )
• Hex:9 HexNAc:8 dHex:1 NeuAc:4 (avg mass : 4414.0315 )
• Hex:9 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 3452.1949 )
• Hex:10 HexNAc:2 (avg mass : 2045.8293 )
• Hex:10 HexNAc:9 (avg mass : 3468.1943 )
• Hex:10 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 3614.3373 )
• Hex:10 HexNAc:10 dHex:1 (avg mass : 3817.5323 )
• Hex:11 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 3166.8947 )
• Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )

Disease

• COVID-19 (DOID:0080600)

Reference

• Deducing the N- and O- glycosylation profile of the spike protein of novel coronavirus SARS-CoV-2 (2020 - Asif Shajahan, Nitin T. Supekar, Anne S. Gleinich, Parastoo Azadi) / Status : Unreviewed
• Site-specific N-glycosylation Characterization of Recombinant SARS-CoV-2 Spike Proteins using High-Resolution Mass Spectrometry (2020 - Yong Zhang, Wanjun Zhao, Yonghong Mao, Shisheng Wang, Yi Zhong, Tao Su, Meng Gong, Xiaofeng Lu, Jingqiu Cheng, Hao Yang) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Recombinant Spike glycoprotein (BTI-Tn-5B1-4) - DRAFT DATA / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
  •        Asn-1159
  •        Asn-1174
• Recombinant Spike glycoprotein (HEK293) - DRAFT DATA / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
  •        Asn-1159
  •        Asn-1174

Mass spectrometry observed peptide

• NHTSPDVDLGDISGINASVVNIQK (24aa)
  •    P0DTC2    Asn-1159
• NHTSPDVDLGDISGINASVVNIQK (24aa)
  •    P0DTC2    Asn-1174
• NHTSPDVDLGDISGINASVVNIQK (24aa)
  •    P0DTC2    Asn-1174
• NHTSPDVDLGDISGINASVVNIQK (24aa)
  •    P0DTC2    Asn-1159