GlyConnect

Taxonomy (1) Protein (1) Source (2) Structure (0) Composition (134) Disease (1) Site (4) Peptide (1)

Taxonomy

Homo sapiens (Human)

Protein

Prostaglandin-h2 d-isomerase / Homo sapiens P41222

Source

Blood Serum (UBERON_0001977)
Urine (UBERON_0001088)

Reported structure

Composition

Disease

Prostate cancer (DOID:10283)

Reported glycosite

Prostaglandin-h2 d-isomerase / Homo sapiens :
- Ser-67
- Thr-73
- Asn-78
- Thr-80

Mass spectrometry validated peptide

SVVAPATDGGLNLTSTFLR (19aa)
- P41222 Ser-67
SVVAPATDGGLNLTSTFLR (19aa)
- P41222 Asn-78
SVVAPATDGGLNLTSTFLR (19aa)
- P41222 Thr-73
SVVAPATDGGLNLTSTFLR (19aa)
- P41222 Thr-80

- Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
- Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2307.1564 )
- Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 3174.9204 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
- Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2792.5555 )
- Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2606.388 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 NeuGc:2
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 2386.1655 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 2751.5029 )
- Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1
- Hex:4 HexNAc:3 NeuGc:1 (avg mass : 1583.4272 )
- Hex:3 HexNAc:3 NeuAc:2 (avg mass : 1696.5433 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1
- Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2485.2982 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuGc:2 (avg mass : 2402.1649 )
- Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3229.9564 )
- Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2501.2976 )
- Hex:7 HexNAc:8
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:1
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2062.9088 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2062.9088 )
- Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 NeuGc:2
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
- Hex:8 HexNAc:7 NeuAc:1
- Hex:6 HexNAc:7 (avg mass : 2413.2347 )
- Hex:3 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 2479.3405 )
- Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:1 NeuGc:1
- Hex:6 HexNAc:3 NeuGc:1
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 NeuGc:1
- Hex:9 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2639.4149 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3100.8409 )
- Hex:7 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 2111.9351 )
- Hex:5 HexNAc:5 (avg mass : 1844.7023 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:4 NeuGc:1
- Hex:6 HexNAc:5 (avg mass : 2006.8447 )
- Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2135.9602 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
- Hex:10 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 3296.0102 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2283.1313 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuGc:2
- Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 1973.8178 )
- Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3757.4362 )
- Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2897.6459 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
- Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
- Hex:6 HexNAc:9 dHex:1
- Hex:5 HexNAc:5 (avg mass : 1844.7023 )
- Hex:4 HexNAc:6 (avg mass : 1885.7549 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 NeuAc:1 NeuGc:1
- Hex:4 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2177.0128 )
- Hex:8 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2477.2725 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2209.0518 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2573.3611 )
- Hex:3 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1405.2854 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2411.2187 )
- Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
- Hex:4 HexNAc:7 (avg mass : 2088.9499 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2015.8985 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuGc:1 (avg mass : 2094.9076 )
- Hex:10 HexNAc:9 dHex:1 NeuAc:4 (avg mass : 4779.3689 )
- Hex:7 HexNAc:4 dHex:2
- Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
- Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2427.2181 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2161.0134 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2371.1942 )
- Hex:8 HexNAc:8
- Hex:5 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2340.1833 )
- Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2647.4406 )
- Hex:5 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 2600.4303 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:3 (avg mass : 2162.0415 )
- Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 NeuGc:2
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2062.9088 )
- Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
- Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 NeuGc:1
- Hex:2 HexNAc:2 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 1477.3489 )
- Hex:5 HexNAc:5 NeuGc:1
- Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2283.1313 )
- Hex:7 HexNAc:4 (avg mass : 1965.7921 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2136.9883 )
- Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2265.0757 )
- Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2590.3886 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2299.1307 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 1974.8459 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
- Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:1 NeuGc:1
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1
- Hex:9 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 3452.1949 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2283.1313 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )
- Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2938.6985 )
- Hex:3 HexNAc:7 (avg mass : 1926.8075 )
- Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2776.5561 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2452.2713 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
- Hex:4 HexNAc:6 (avg mass : 1885.7549 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:1
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuGc:1
- Hex:5 HexNAc:4 NeuGc:2 (avg mass : 2256.0219 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuGc:1
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuGc:2
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 NeuGc:2
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1916.7658 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:4 (avg mass : 3683.3567 )
- Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1957.8184 )
- Hex:7 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2315.1301 )
- Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:4 (avg mass : 3537.2137 )
- Hex:6 HexNAc:8 (avg mass : 2616.4297 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 NeuGc:1 (avg mass : 3042.7608 )
- Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1957.8184 )
- Hex:8 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 3086.8575 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3392.0988 )
- Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2266.1038 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
- Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
- Hex:4 HexNAc:7 dHex:2
- Hex:7 HexNAc:7 dHex:1 NeuAc:2 NeuGc:1
- Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 2240.0225 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:2 NeuGc:1
- Hex:5 HexNAc:4 NeuGc:1 (avg mass : 1948.7646 )
- Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:1 NeuGc:1 (avg mass : 2970.6973 )
- Hex:7 HexNAc:5 (avg mass : 2168.9871 )
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2037.8556 )
- Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2663.44 )
- Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuGc:1
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
- Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
- Hex:8 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2825.5824 )
- Hex:3 HexNAc:3 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 1988.8293 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 NeuAc:2 (avg mass : 2662.4521 )

References (2)

Distinct urinary glycoprotein signatures in prostate cancer patients (2018)
Rebeca Kawahara, Fabio Ortega, Livia Rosa-Fernandes, Vanessa Guimarães, Daniel Quina, Willian Nahas, Veit Schwämmle, Miguel Srougi, Katia R.M. Leite, Morten Thaysen-Andersen, Martin R. Larsen and Giuseppe Palmisano
Pubmed : 30237853 DOI : 10.18632/oncotarget.26005
Status : Unreviewed

Large-scale intact glycopeptide identification by Mascot database search (2018)
Ravi Chand Bollineni, Christian Jeffrey Koehler, Randi Elin Gislefoss, Jan Haug Anonsen, Bernd Thiede
Pubmed : 29391424 DOI : 10.1038/s41598-018-20331-2
Status : Unreviewed