NISQDLEK (8aa)

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)
• Mus musculus (House mouse)

Protein

• Laminin subunit gamma-1 / Homo sapiens    P11047
• Laminin subunit gamma-1 / Mus musculus    P02468

Source

• Blood Serum (UBERON_0001977)  
• Brain (UBERON_0000955)  
• Mammary Gland (UBERON_0001911)  

Reported structure

Composition

• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
• Hex:3 HexNAc:8 (avg mass : 2130.0025 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1713.5708 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
• Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:4 (avg mass : 2226.0793 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2242.0787 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2589.3605 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2356.1827 )
• Hex:7 HexNAc:6 (avg mass : 2372.1821 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
• Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )

Disease

• Cancer, breast (DOID:1612)
• Prostate cancer (DOID:10283)

Reference

• Capturing site-specific heterogeneity with large-scale N-glycoproteome analysis (2019 - Nicholas M. Riley, Alexander S. Hebert, Michael S. Westphall & Joshua J. Coon ) / Status : Unreviewed
• Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018 - Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang) / Status : Unreviewed
• Large-scale intact glycopeptide identification by Mascot database search (2018 - Ravi Chand Bollineni, Christian Jeffrey Koehler, Randi Elin Gislefoss, Jan Haug Anonsen, Bernd Thiede) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Laminin subunit gamma-1 / Homo sapiens
  •        Asn-1241
• Laminin subunit gamma-1 / Mus musculus
  •        Asn-1239

Mass spectrometry observed peptide

• NISQDLEK (8aa)
  •    P02468    Asn-1239
• NISQDLEK (8aa)
  •    P11047    Asn-1241