GlyConnect

Taxonomy (1) Protein (1) Source (2) Structure (0) Composition (66) Disease (2) Site (1) Peptide (1)

Taxonomy

Homo sapiens (Human)

Protein

Lysosome-associated membrane glycoprotein 2 / Homo sapiens P13473

Source

Mammary Gland (UBERON_0001911)
Blood Serum (UBERON_0001977)

Reported structure

Composition

Disease

Prostate cancer (DOID:10283)
Cancer, breast (DOID:1612)

Reported glycosite

Lysosome-associated membrane glycoprotein 2 / Homo sapiens :
- Asn-356

Mass spectrometry validated peptide

VQPFNVTQGK (10aa)
- P13473 Asn-356

- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
- Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2792.5555 )
- Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
- Hex:6 HexNAc:3 (avg mass : 1600.4547 )
- Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2590.3886 )
- Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )
- Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
- Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1713.5708 )
- Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
- Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
- Hex:5 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1729.5702 )
- Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
- Hex:4 HexNAc:3 (avg mass : 1276.1699 )
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:3
- Hex:6 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2501.2976 )
- Hex:4 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1219.1179 )
- Hex:3 HexNAc:2 (avg mass : 910.8325 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
- Hex:8 HexNAc:7 (avg mass : 2737.5195 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2242.0787 )
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:2
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
- Hex:6 HexNAc:5 (avg mass : 2006.8447 )
- Hex:4 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1770.6228 )
- Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
- Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
- Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:1
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:4
- Hex:5 HexNAc:3 dHex:3
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2299.1307 )
- Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2194.0403 )
- Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
- Hex:5 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1730.5983 )
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2037.8556 )
- Hex:7 HexNAc:6 (avg mass : 2372.1821 )
- Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1746.5977 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
- Hex:5 HexNAc:5 (avg mass : 1844.7023 )
- Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:2 (avg mass : 2516.3091 )
- Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2664.4681 )
- Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
- Hex:4 HexNAc:6 (avg mass : 1885.7549 )
- Hex:4 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1567.4278 )
- Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
- Hex:5 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1381.2603 )
- Hex:7 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 2111.9351 )
- Hex:6 HexNAc:4 (avg mass : 1803.6497 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
- Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:4 (avg mass : 2591.4167 )
- Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
- Hex:12 HexNAc:2 (avg mass : 2370.1141 )
- Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:7
- Hex:8 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2883.6625 )
- Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
- Hex:5 HexNAc:4 dHex:4
- Hex:5 HexNAc:6 (avg mass : 2047.8973 )

References (2)

Reanalysis of global proteomic and phosphoproteomic data identified a large number of glycopeptides (2018)
Yingwei Hu, Punit Shah, David J. Clark, Minghui Ao, Hui Zhang
Pubmed : 29741879 DOI : 10.1021/acs.analchem.8b01137
Status : Unreviewed

Large-scale intact glycopeptide identification by Mascot database search (2018)
Ravi Chand Bollineni, Christian Jeffrey Koehler, Randi Elin Gislefoss, Jan Haug Anonsen, Bernd Thiede
Pubmed : 29391424 DOI : 10.1038/s41598-018-20331-2
Status : Unreviewed