T-cell childhood acute lymphocytic leukemia

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C / Homo sapiens    P08575

Source

• Jurkat (CVCL_0065)  

Reported structure

Composition

• HexNAc:11 (avg mass : 2253.1603 )
• Hex:1 HexNAc:2 NeuAc:1 (avg mass : 877.8056 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1729.5702 )
• Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2371.1942 )
• Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2135.9602 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2589.3605 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:3 (avg mass : 2880.6184 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2590.3886 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2445.2737 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )

Disease

• T-cell childhood acute lymphocytic leukemia (DOID:0080145)

Reference

• Glycoproteomic Analysis of MGL-Binding Proteins on Acute T-Cell Leukemia Cells. (2019 - Martina Pirro, Esmee Schoof, Sandra J. van Vliet, Yoann Rombouts, Alexandre Stella, Arnoud de Ru, Yassene Mohammed, Manfred Wuhrer, Peter A. van Veelen, Paul J. Hensbergen) / Status : Reviewed

Reported glycosite

• Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C / Homo sapiens
  •        Ser-142
  •        Ser-176
  •        Asn-234
  •        Asn-278
  •        Asn-337
  •        Asn-380
  •        Asn-421
  •        Asn-470

Mass spectrometry observed peptide

• LNPTPGSNAISDVPGER (17aa)
  •    P08575    Ser-142     Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C / Homo sapiens
• STASTFPTDPVSPLTTTLSLAHHSSAALPAR (31aa)
  •    P08575    Ser-176     Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C / Homo sapiens
• YANITVDYLYNK (12aa)
  •    P08575    Asn-234     Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C / Homo sapiens
• YANITVDYLYNKETK (15aa)
  •    P08575    Asn-234     Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C / Homo sapiens
• NASVSISHNSCTAPDK (16aa)
  •    P08575    Asn-278     Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C / Homo sapiens
• NIETFTCDTQNITYR (15aa)
  •    P08575    Asn-337     Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C / Homo sapiens
• FTNASK (6aa)
  •    P08575    Asn-380     Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C / Homo sapiens
• SFHNFTLCYIK (11aa)
  •    P08575    Asn-421     Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C / Homo sapiens
• NGSAAMCHFTTK (12aa)
  •    P08575    Asn-470     Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C / Homo sapiens