Cell line RPMI-1788

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• Erythropoietin / Homo sapiens    P01588

Source

• RPMI-1788 (CVCL_2710)   B-Lymphocyte (CL_0000236)  

Reported structure

• N-Linked / Complex / Man(a1-3)[Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ GlcNAc"
• N-Linked / Complex / Man(a1-3)[Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc+"+ 2 x GlcNAc"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)[Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Man(a1-3)[Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ 2 x GlcNAc"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)[GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc
• N-Linked / Complex / Fuc(?1-?)[Gal(?1-?)]GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)[Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)[GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)[GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ Fuc"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ Fuc"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[GlcNAc(?1-?)]Man(a1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ Fuc"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ Fuc"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Man(a1-?)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ GlcNAc"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ Fuc"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ Gal(?1-?)GlcNAc"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?) + Fuc(?1-?)"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?) + GlcNAc(?1-?)"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ 2 x Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ 2 x Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?) + Fuc(?1-?)"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ 3 x Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ 3 x Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?) + Fuc(?1-?)"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ 4 x Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ 4 x Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?) + Fuc(?1-?)"
• N-Linked / Complex / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-3)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Man(a1-6)][GlcNAc(?1-4)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)[Fuc(?1-6)]GlcNAc+"+ 5 x Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)"

Composition

• Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
• Hex:3 HexNAc:4 (avg mass : 1317.2225 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:2 (avg mass : 1568.4559 )
• Hex:4 HexNAc:4 (avg mass : 1479.3649 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
• Hex:5 HexNAc:5 (avg mass : 1844.7023 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2136.9883 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2194.0403 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2299.1307 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2356.1827 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2502.3257 )
• Hex:6 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2559.3777 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2721.5201 )
• Hex:7 HexNAc:7 dHex:2 (avg mass : 2867.6631 )
• Hex:8 HexNAc:8 dHex:1 (avg mass : 3086.8575 )
• Hex:8 HexNAc:8 dHex:2 (avg mass : 3233.0005 )
• Hex:8 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 3290.0525 )
• Hex:9 HexNAc:9 dHex:1 (avg mass : 3452.1949 )
• Hex:9 HexNAc:9 dHex:2 (avg mass : 3598.3379 )
• Hex:10 HexNAc:10 dHex:1 (avg mass : 3817.5323 )
• Hex:10 HexNAc:10 dHex:2 (avg mass : 3963.6753 )
• Hex:11 HexNAc:11 dHex:1 (avg mass : 4182.8697 )
• Hex:11 HexNAc:11 dHex:2 (avg mass : 4329.0127 )
• Hex:12 HexNAc:12 dHex:1 (avg mass : 4548.2071 )

Disease

Reference

• Unusual N-glycosylation of a recombinant human erythropoietin expressed in a human lymphoblastoid cell line does not alter its biological properties. (2000 - Cointe D, Bliard R, Jorieux S, Leroy Y, Glacet A, Verbert A, Bourel D, Chirat F) / Status : Reviewed

Reported glycosite

• Erythropoietin / Homo sapiens
  •        Asn-51
  •        Asn-65
  •        Asn-110

Mass spectrometry observed peptide