Cell line LS174T

Taxonomy

• Homo sapiens (Human)

Protein

• Unspecified mucin / Homo sapiens

Source

• Colon (UBERON_0001155)   LS174T (CVCL_1384)  

Reported structure

• O-Linked / Core 0 / GalNAc
• O-Linked / Core 0 / NeuAc(a2-6)GalNAc
• O-Linked / No-core / Fuc(?1-?)Gal(?1-3)GalNAc
• O-Linked / No-core / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-6)[Gal(?1-3)]GalNAc
• O-Linked / No-core / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)Gal(?1-3)GalNAc
• O-Linked / No-core / Fuc(?1-?)[Gal(?1-?)]GlcNAc(?1-6)[Gal(?1-3)]GalNAc
• O-Linked / No-core / Fuc(?1-?)[Gal(?1-?)]GlcNAc(?1-?)Gal(?1-3)GalNAc
• O-Linked / No-core / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[GlcNAc(?1-?)]Gal(?1-3)GalNAc
• O-Linked / No-core / NeuAc(?2-?)Gal(?1-3)[NeuAc(?2-6)]GalNAc
• O-Linked / No-core / NeuAc(?2-?)Gal(?1-?)GlcNAc(?1-6)[Gal(?1-3)]GalNAc
• O-Linked / No-core / Fuc(?1-?)Gal(?1-?)[Fuc(?1-?)]GlcNAc(?1-?)Gal(?1-3)GalNAc
• O-Linked / No-core / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Gal(?1-3)GalNAc
• O-Linked / No-core / Fuc(?1-?)[Gal(?1-?)]GlcNAc(?1-6)[NeuAc(?2-?)Gal(?1-3)]GalNAc
• O-Linked / No-core / Fuc(?1-?)[Gal(?1-?)]GlcNAc(?1-?)[Gal(?1-?)GlcNAc(?1-?)]Gal(?1-3)GalNAc
• O-Linked / Undefined core / Gal(?1-3)GalNAc
• O-Linked / Undefined core / Gal(?1-3)[GlcNAc(?1-6)]GalNAc
• O-Linked / Undefined core / GlcNAc(?1-?)Gal(?1-3)GalNAc
• O-Linked / Undefined core / Gal(?1-3)[NeuAc(?2-6)]GalNAc
• O-Linked / Undefined core / NeuAc(?2-?)Gal(?1-3)GalNAc
• O-Linked / Undefined core / NeuAc(?2-?)Gal(?1-3)[GlcNAc(?1-6)]GalNAc
• O-Linked / Undefined core / Gal(?1-?)GlcNAc(?1-6)[NeuAc(?2-?)Gal(?1-3)]GalNAc

Composition

• HexNAc:1 (avg mass : 221.2103 )
• HexNAc:1 NeuAc:1 (avg mass : 512.4682 )
• Hex:1 HexNAc:1 (avg mass : 383.3527 )
• Hex:1 HexNAc:1 NeuAc:1 (avg mass : 674.6106 )
• Hex:1 HexNAc:1 NeuAc:2 (avg mass : 965.8685 )
• Hex:1 HexNAc:1 dHex:1 (avg mass : 529.4957 )
• Hex:1 HexNAc:2 (avg mass : 586.5477 )
• Hex:1 HexNAc:2 NeuAc:1 (avg mass : 877.8056 )
• Hex:2 HexNAc:2 (avg mass : 748.6901 )
• Hex:2 HexNAc:2 NeuAc:1 (avg mass : 1039.948 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 894.8331 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1186.091 )
• Hex:2 HexNAc:2 dHex:2 (avg mass : 1040.9761 )
• Hex:2 HexNAc:3 (avg mass : 951.8851 )
• Hex:3 HexNAc:3 (avg mass : 1114.0275 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )

Disease

• Adenocarcinoma (DOID:299)

Reference

• Neutralization of pH in the Golgi apparatus causes redistribution of glycosyltransferases and changes in the O-glycosylation of mucins. (2001 - Axelsson M, Karlsson N, Steel D, Ouwendijk J, Nilsson T, Hansson G) / Status : Reviewed

Reported glycosite

• Unspecified mucin / Homo sapiens
  •        Undefined site

Mass spectrometry observed peptide